Digitalización de objetos de colecciones de ciencias naturales en el Museu de Ciències Naturals de Barcelona - Jordi Agulló

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Digitalización de objetos de colecciones de ciencias naturales en el Museu de Ciències Naturals de Barcelona - Jordi Agulló
Digitalización de objetos de
colecciones de ciencias
naturales en el Museu de
Ciències Naturals de Barcelona

         23 de septiembre de 2021

                        Jordi Agulló
                        Gestión Científica de colecciones, MCNB
Digitalización de objetos de colecciones de ciencias naturales en el Museu de Ciències Naturals de Barcelona - Jordi Agulló
23 de septiembre de 2021

 Proceso de digitalización: fases

 Ejemplos de colecciones de imágenes

 Ejemplo práctico: Atlas osteológico 3D
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23 de septiembre de 2021
Digitalización de objetos de colecciones de ciencias naturales en el Museu de Ciències Naturals de Barcelona - Jordi Agulló
23 de septiembre de 2021

Digitalización de objetos de colecciones de
ciencias naturales

     Digitalización ~ Imaging                         Global Trade Review

     Objeto de colección : Elemento que se custodia
Digitalización de objetos de colecciones de ciencias naturales en el Museu de Ciències Naturals de Barcelona - Jordi Agulló
23 de septiembre de 2021

               Beneficios de la digitalización

Información testimonial.
Favorece la conservación.
Aumenta la capacidad de estudio
Incrementa tu perfil de colección/Institución en internet.
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23 de septiembre de 2021

         Proceso de digitalización

                         PLANIFICACIÓN
                                                        DOCUMENTACIÓN
                         -Identificar
                         objetivos                                    CUSTODIA DIGITAL
                                                        -Guias y
                                                        protocolos                  EVALUACIÓN
                         -Plan de                                     Digital Asset
                         acción                         -Estándard de Management -Métricas
                                                        Metadatos
                                                                                    -Feedback de
                                                                                    los usuarios

• Frazier, C.K., Wall, J., and S. Grant. (2008). Initiating a Natural History Collection Digitisation Project,
  version 1.0. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility.
• Chavan, V., Berents, P. & Hamer, M. (2010). Towards Demand Driven Publishing: Approaches to the
  Prioritisation of Digitization of Natural History Collections Data. Biodiversity Informatics, 7
• Huxley, R., Quaisser, C., Butler, C.R., & Dekker, R.W. (2020). Managing Natural Science Collections: A
  Guide to Strategy, Planning and Resourcing (1st ed.). Routledge.
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• INVENTARIO
• INVESTIGACIÓN
    o TIPOS
    o PETICIONES INVESTIGADORES
    o LÁMINA DELGADA
    o MICROFORAMINÍFEROS
    o Etc.
• TEMÁTICOS
    o Meteoritos
    o Gemas
    o Gabinet Salvador
    o Atlas 3D
    o Colección de referencia
    o Etc.
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                       INVENTARIO

COLECCIÓN       TÉCNICA
VERTEBRADOS y   Cámara reflex
INVETREBRADOS   digital
NO ARTRÓPODOS                       Autor: Jordi Vidal
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23 de septiembre de 2021
                                           INVENTARIO

                                                                                           Autor: Joan Rosell
                    Autor: Joan Rosell

                                           Autor: Jordi Vidal      Autor: Jordi Vidal

                      Autor: Jordi Vidal

                                                                                                Autor: Jordi Vidal

COLECCIÓN      TÉCNICA
MINERALOGÍA,   Cámara reflex digital con
PETROLOGÍA Y   ópticas macro
PALEONTOLOGÍ

                                                                Autor: Jordi Vidal
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23 de septiembre de 2021
                                 INVENTARIO

           Autor: Sergi Gago

                                                                                                  Autor: Sergi Gago

                                               Autor: Miguel Prieto

                                                           COLECCIÓN    TÉCNICA

                                                           MOLUSCOS y   Cámara de reflex digital y stacking

                                                           ARTRÓPODOS   - Lens: Canon EF 100 mm f/2.8 Macro
                                                                        USM
                                                                        - Flash: Macro ring lite Canon MR14EX
                                                                        - Color reference target: X-Rite
                                                                        ColorChecker Passport
                                                                        - First images: RAW, at 1/125 s,
                                                                        f/5.6 and ISO 100
                                                                        - Software to adjust RAW files and
                                                                        save as Tiff: Canon Digital Photo
                                                                        Professional.
                                                                        - FS software: Helicon Focus
Autor: Sergi Gago              Autor: Sergi Gago
23 de septiembre de 2021
                                      INVENTARIO

                                                        Autor: Jordi Pallàs
                                                                                           Autor: Jordi Pallàs

                                            COLECCIÓN          TÉCNICA
                                            HERBARIO           Digitalización de pliegos: Escáner
                                                               invertido Herbscan 300 dpi

                                                               Digitalización de herbarios históricos
                                                               :Escáner Copybook a 300dpi

Autor: Jordi Pallàs y Eduard Farràs
23 de septiembre de 2021
INVENTARIO

                               Autor: Míriam Aixart

      COLECCIÓN   TÉCNICA
      BANCO DE    Digitalización con escáner sobre papel
      SEMILLAS    milimetrado
Consulta                            23 de septiembre de 2021

           https://www.bioexplora.cat/es/colecciones-abiertas
Tipos                                                                   23 de septiembre de 2021

                                                                                            Autor: Neus Ibáñez
                            COLECCIÓN                TÉCNICA

                            HERBARIO                 Digitalización de pliegos te tipos: Escáner
                                                     invertido Herbscan 600 dpi

                       Häuser, C.L., Steiner, A., Holstein, J. & Scoble, M. J. (eds.) 2005. Digital Imaging of Biological Type
Autor: Neus Ibáñez     Specimens. A Manual
                       of Best Practice. Results from a study of the European Network for Biodiversity Information. Stuttgart.
Consulta                 23 de septiembre de 2021

TIPOS Institut Botànic de Barcelona              https://doi.org/10.15468/dl.jbdpf7
Tipos                                                             23 de septiembre de 2021

Autor: Amador Viñolas
                                Häuser, C.L., Steiner, A., Holstein, J. & Scoble, M. J. (eds.) 2005. Digital Imaging of
                                Biological Type Specimens. A Manual                               Autor: Sergi Gago
                                of Best Practice. Results from a study of the European Network for Biodiversity
                                Information. Stuttgart. 304 pp.
Consulta                 23 de septiembre de 2021

TIPOS Colecciones Zoológicas              https://doi.org/10.15468/dl.kxw9jy
Consulta                                            23 de septiembre de 2021

TIPOS Colecciones Zoológicas          https://www.bioexplora.cat/WIKICOLLECTA/index.php/es/especimens-tipus
Consulta                                                     23 de septiembre de 2021

     https://www.icgc.cat/es/Administracion-y-empresa/Servicios/Geologia/Base-de-datos-de-holotipos-y-otros-tipos-nomenclaturales

TIPOS Colección Paleontología
Investigación                                                       23 de septiembre de 2021

                                                                              Lámina delgada: Olivina. Autor: Marc Campeny
COLECCIÓN                            USO                                      TÉCNICA

MINERALOGÍA y PETROLOGÍA.            Para documentación e investigación.      A través del microscopio petrográfico de
Colección de LÁMINA DELGADA.         Interpretaciones texturales y            luz polarizada, acoplando cámara digital
Cortes transversales micrométricos   genéticas de las rocas (identificación   Deltapix al microscopio. Software
30 µm.) de muestras de minerales y   de compuestos minerales).                DeltaPix InSight.
rocas en preparaciones para
microscopio.
Investigación                                                      23 de septiembre de 2021

Genitalia de Holocnemus aurouxi Barrientos,
                                                               Genitalia: bulbo copulador de Linyphiidae.
2019. Autor: Jorge Mederos
                                                               Autor: Jorge Mederos

            COLECCIÓN                      USO                                   TÉCNICA

            ARTRÒPODOS. Preparaciones de   Para documentación e investigación.   Se adquiere con una cámara acoplada
            genitalias de Artrópodos       Permite el estudio taxonómico y       al triocular del microscopio óptico o lupa
                                           sistemático del espécimen             binocular con iluminación de fibra de
                                                                                 óptica.
Temáticos                                    23 de septiembre de 2021

https://www.bioexplora.cat/WIKICOLLECTA/index.php/es/briozous
23 de septiembre de 2021
                        Ejemplo Atlas 3D

Objetivo inicial : Atlas osteológico de vertebrados principalmente autóctonos.

                                              Compra de instrumentación
                                              Depuración de la técnica
                                              Documentación del objeto digital
                                              Visualización del modelo 3d en web
                                              Consulta web
                                              Métricas del uso en internet
23 de septiembre de 2021
                               Ejemplo Atlas 3D

 Compra de instrumentación

                                                   http://www.nextengine.com/products/scanner/specs#

      Software: ScanStudio ProScan http://www.nextengine.com/products/scanstudio-hd-pro/specs/overview
      MesahLab (freeware) https://www.meshlab.net/
23 de septiembre de 2021
                           Ejemplo Atlas 3D

 Depuración de la técnica, Documentación y
  Custodia digital

                                                   ©MCNB/Jordi Cadevall

                            ©MCNB/Jordi Cadevall
23 de septiembre de 2021
                             Ejemplo Atlas 3D
                                Depuración de la técnica :Fotogrametría

©MCNB

                              ©MCNB/Jordi Cadevall

                                                                                      ©MCNB
Agisoft Metashape https://www.agisoft.com/
23 de septiembre de 2021
                          Ejemplo Atlas 3D

 Visualización del modelo 3d en web

                           ©MCNB/Jordi Cadevall

                                                  https://sketchfab.com/
23 de septiembre de 2021
               Ejemplo Atlas 3D

Consulta web

                               Quesada, J., Aurell-Garrido, J., Gago, S., Boet, O & Garcia-Franquesa, E. 2016.
                ©MCNB/Jordi Cadevall
                               Measurements errors in 3D models used in osteometric data research with
                               freeware: a test using skulls of the Algerian hedgehog (Atelerix algirus).
                               Vertebrate Zoology , 66 (3): 411-418.
23 de septiembre de 2021
                                     Métricas

 Métricas del uso en internet

                          ©MCNB/Jordi Cadevall
23 de septiembre de 2021
           Métricas

©MCNB/Jordi Cadevall
©MCNB/Jordi Cadevall

                       Jordi Agulló
                       Gestión Científica de colecciones, MCNB
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