LA IMPORTANCIA DE LAS VARIANTES DE SARS-COV-2 - DR. MARIO CALVO ARELLANO 3 DE MARZO DE 2021

La importancia de las
variantes de SARS-CoV-2
                Dr. Mario Calvo Arellano
                     3 de marzo de 2021

Antes de empezar, considerar…
• Ninguna intervención aislada ha demostrado bloquear en forma
  altamente significativa el virus, un gran error, ha sido la
  sobreestimación de algunas intervenciones.

Que es una variante
• El virus muta con alta frecuencia, tal como lo hacen los virus
  respiratorios.
• ¿POR QUÉ?
• Es un virus animal que en cada paso se va adaptando al humano.
• La alta circulación viral facilita que se vaya produciendo este
  fenómeno.
• A medida que personas que ya han tenido la infección se va
  adaptando a estos.
• A medida que hay más población vacunada va adaptándose a estos.

¿Que es una variante?

Variantes importantes: Proteína S

Como funcionan las variantes:
Llave cerradura

Transmisibilidad

Esto es seguido en forma activa:
https://www.gisaid.org/hcov19-variants/

¿Cuantas variantes?

Country       %VUI202012/01 GR/501Y.V1 (B.1.1.7) in past 4 weeks

                                          United
                                          Kingdom       95.3
                                          Denmark       49.4
                                          Belgium       44.8

        Porcentaje                        USA           6.2

         variantes                        France        50.5
                                          Italy         43.8
         últimas 4                        Netherlands   31.8
         semanas                          Ireland       59.7
                                          Spain         27.2
                                          Switzerland   31.6
                                          Turkey        20.1
                                          Israel        0.0
https://www.gisaid.org/hcov19-variants/   Sweden        51.9

Cuando hay una variante que puede
tener consecuencias importantes

• Se la denomina VOC (“variant of concern).
• Variante Británica (B.1.1.7, detectada UK 9/20, 14-feb-21 en
  30 de 39 estados de USA)
• Variante Sudafricana (B.1.351 o 501.V2)
• Variante Brasileña (P.1, dic 2020 y 1.1.248)

Cuando se estudian bien, cada mutación de
una variante parece tener sentido

                                      WHO-reunión
                                      nuevas variantes

Consecuencias
• Cepas nuevas en condiciones “especiales”
• Transmisibilidad
• Mortalidad
• Reinfección
• Escape inmunológico vacunas

Condiciones especiales
  • En Junio de 2020 Dinamarca reportó en granjas de visones.
  • El 5 de noviembre las autoridades de salud reportaron la detección
    del cluster 5 en 12 casos humanos en North Judland.
  • 8 casos eran personas en contacto con granjas y 4 de la comunidad.
  • Se planteó que la variante era menos sensible a los Ac neutralizantes.
  • Consecuencias: Sacrificio de millones de visones.

https://www.who.int/csr/don/06-november-2020-mink-associated-sars-cov2-denmark/en/

Transmisibilidad

Transmisibilidad
• Cepa británica alrededor de 50% más transmisible.
• Cepa brasileña aparentemente más transmisible que la británica.

Variante inglesa(VUI-202012/01 o B1.1.7)
• Analizaron 52% de los PCR entre 1 sept 2020 y 5 feb 2021 (técnica
  PCR utilizada permitía identificar la cepa)
• El riesgo de fallecer es un 58% mayor (para un de 55 a 69 años, el
  riesgo aumento de 0,6 a 0,9%)
• Transmisibilidad un 50% mayor.

 Davies et al. https://doi.org/10.1101/2021.02.01.21250959

Avance en UK

https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/COVID-19-risk-related-to-spread-of-new-SARS-CoV-2-
variants-EU-EEA-first-update.pdf

Sudafrica

Cepa brasileña (P.1, descendiente de B.1.1.28)
• Estudio se hace por gran aumento de hospitalizaciones en Manaos
• Noviembre de 2020. Tiene 17 mutaciones (10 en spike).
• Se estima que 1,4 a 2,2 veces más transmisible.
• Evade 25 a 61% de la inmunidad generada por la infección natural.
• Puede infectar personas ya infectadas previamente por cepa estándar.
• En Manaus se ha postulado (con ajustes) qye 67% de la población se
  ha infectado con SARS-CoV-2 (estándar + no estándar).

Faria N et al 2021. Preprinti.

Cepa predominante en Manaos
• En 7 semanas paso de un
  0% a 87% de los aislados.
• No esta claro efecto de
  mortalidad, ya que el
  exceso de mortalidad en
  la ola reciente puede
  estar relacionado a
  saturación del sistema de
  salud.

Variantes en USA
   • Clade 20 G. 27,8% de aislados en Louisiana cerca de Año Nuevo.
   • Q667P el 3 de febrero 499 secuencias en USA. Al menos 6 sub-linajes
     Q677H
   • Otro grupo de variantes S677

Hodcroft et al. https://doi.org/10.1101/2021.02.12.21251658

En Chile también estamos recibiendo

 2021 Informe ISP.

Impacto en vacunas
• Novavax. Comunicación productores 89% eficacia global
• Pero 96% cepa estándar, 86% Británica,

Vacuna Pfizer y cepa sudafricana

Swanson et al. NEJM feb 2021.

Vacuna Moderna y variantes

 Moderna estaría desarrollando vacuna contra variante (vacuna mRNA-1273.351
  Wu K. N Engl J Med 2021. DOI: 10.1056/NEJMc2102179

Disminución efectividad medicamentos
   Cepa                     Terápia                       Cambio                   Causa

   B1.351                   Plasma convalesciente         (-) 11 a 33 veces        Mut E484K
   B1.351                   Plasma vacunado               (-) 6,5 a 8,6 veces
   B1.351                   bamlanivimab (LY-CoV555)      Inefectivo
   B1.351 y b.1.1.7         REGEN-CoV                     Activo (imdevimab
                                                          mantiene, pero
                                                          casirivimab reduce)

https://www.europeanpharmaceuticalreview.com/news/141160/study-finds-some-antibody-therapies-are-
not-effective-against-new-covid-19-variants/

Efectos
       combinados

Science 2021, Feb 19. The long road.
(asumienfo eficacia vacuna 60%)

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