Innovation with an impact - Biotechnology Area - Food For Life-Spain

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Innovation with an impact - Biotechnology Area - Food For Life-Spain
Biotechnology Area

                                     Nutrition and
                                        health

                                                     Omic sciences

  Dr. Antoni Caimari Palou             Innovation
                                       with an impact
Director del Área de Biotecnología
    antoni.caimari@eurecat.org
                                                                     1
Innovation with an impact - Biotechnology Area - Food For Life-Spain
RED DE TECNOLOGÍAS ÓMICAS
                           APLICADAS A LA INNOVACIÓN Y DESARROLLO INDUSTRIAL
                        DE INGREDIENTES, ALIMENTOS FUNCIONALES Y NUTRACÉUTICOS

Consorcio de la Red de Excelencia Cervera:                            Financiada por:
Innovation with an impact - Biotechnology Area - Food For Life-Spain
ÍNDICE

1     Ciencias ómicas y alimentación funcional

2     La Red Tecnomifood

3     Servicios de la Red Tecnomifood

4     Consorcio

5     Ejemplo de aplicación de ómicas

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Innovation with an impact - Biotechnology Area - Food For Life-Spain
Potential
                                          Omic sciences

             Elucidation of mechanisms of action of
              Bioactive ingredient

             Bioavailability studies of bioactive
              ingredients and functional foods through
              the analysis of biomarker consumption

             Food Fraud

             Food Safety

                              Biotechnology
Innovation with an impact - Biotechnology Area - Food For Life-Spain
Agriculture
  Health
              Omics Applications in Biotechnology
   Food
 Pharma
Veterinary                      BIOMARKERS
                  ACTION
                 MECHANISM     IDENTIFICATION

                                                CARACTHERIZATION OF NATURAL
                                                   BIOACTIVE COMPOUNDS

                 PRECISION
                                 MICROBIOTA
                 NUTRITION

                                                        Biotechnology
Innovation with an impact - Biotechnology Area - Food For Life-Spain
Ciencias ómicas y alimentación funcional
Las tecnologías ómicas, clave para mejorar la salud de las personas

•   La salud es uno de los principales motores de          “El uso de las ciencias ómicas
    decisión del consumidor y un atributo incuestionable
    para dotar de valor añadido a un alimento.
                                                           en alimentación es esencial
                                                           para afrontar la tendencia hacia
•   Las tecnologías ómicas profundizan en el
                                                           la personalización de las
    conocimiento de cómo los alimentos repercuten
    en la prevención o la evolución de las                 recomendaciones nutricionales
    enfermedades, permitiendo así mejorar la nutrición     como estrategia para la
    humana y sus consecuencias para la salud.              promoción de la salud”.
•   Actualmente, a pesar de su enorme potencial, la
    incorporación de las ciencias ómicas a la I+D
    empresarial del sector de la alimentación
    saludable es todavía residual.

                                                                                          6
Innovation with an impact - Biotechnology Area - Food For Life-Spain
La Red Tecnomifood
Innovación y desarrollo industrial de ingredientes,
alimentos funcionales y nutracéuticos

La Red de Excelencia Cervera Tecnomifood
tiene como objetivo facilitar el acceso
empresarial a las tecnologías ómicas y la
optimización de su uso, en todas las etapas de la
cadena de valor para el diseño y la evaluación de
ingredientes,    alimentos      funcionales     y
nutracéuticos.

                                                      7
Innovation with an impact - Biotechnology Area - Food For Life-Spain
Servicios de la Red Tecnomifood
      4 ejes que se despliegan en diferentes actividades

  1    Capacitación tecnológica:                            3   Internacionalización:
       Validación clínica y preclínica, cribado de              Movilización de empresas en proyectos
       ingredientes, análisis de datos, prueba de               internacionales, participación en Programas Marco de
       conceptos y protocolos obtenidos en actividades          la UE o EEI, colaboraciones internacionales y redes y
       anteriores.                                              participación en sociedades y foros internacionales

  2    Recursos:                                            4   Transferencia tecnológica, explotación y
       Formación pre-doctoral, postdoctoral y de
                                                                difusión de resultados:
       personal técnico y atracción de talento nacional e       Transferencia de tecnología y dinamización de la
       internacional.                                           inversión empresarial, formas de protección de la
                                                                propiedad industrial e intelectual, acciones de
                                                                promoción al emprendimiento empresarial en la
Actividades enfocadas a optimizar los procesos de               tecnología Cervera, difusión de las actividades de la
selección y validación de nuevos ingredientes con               Red.
potencial saludable

                                                                                                                        8
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Servicios de la Red Tecnomifood

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Servicios de la Red Tecnomifood

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Servicios de la Red Tecnomifood

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Servicios de la Red Tecnomifood
      4 ejes que se despliegan en diferentes actividades

  1    Capacitación tecnológica:                            3   Internacionalización:
       Validación clínica y preclínica, cribado de              Movilización de empresas en proyectos
       ingredientes, análisis de datos, prueba de               internacionales, participación en Programas Marco de
       conceptos y protocolos obtenidos en actividades          la UE o EEI, colaboraciones internacionales y redes y
       anteriores.                                              participación en sociedades y foros internacionales

  2    Recursos:                                            4   Transferencia tecnológica, explotación y
       Formación pre-doctoral, postdoctoral y de
                                                                difusión de resultados:
       personal técnico y atracción de talento nacional e       Transferencia de tecnología y dinamización de la
       internacional.                                           inversión empresarial, formas de protección de la
                                                                propiedad industrial e intelectual, acciones de
                                                                promoción al emprendimiento empresarial en la
Actividades enfocadas a optimizar los procesos de               tecnología Cervera, difusión de las actividades de la
selección y validación de nuevos ingredientes con               Red.
potencial saludable

                                                                                                                        12
Consorcio
La Red Tecnomifood está formada por 5 Centros Tecnológicos que cuentan con una
marcada trayectoria científico-tecnológica que les ha situado como referentes a nivel
nacional y europeo

                                                                                        13
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             Multi-ingrediente frente a NAFLD
 Hígado graso no alcohólico (NAFLD): desorden metabólico multifactorial de amplio espectro
  caracterizado por una acumulación de lípidos en el hígado y asociado a otros desórdenes
  metabólicos (ej: resistencia a la insulina, dislipidemia) y a la obesidad. Diagnóstico:> 5% de
  hepatocitos esteatóticos en un corte histológico (biopsia).
 Elevada prevalencia: se estima que afecta entre 20-30% de la población mundial 1 de cada 3
  adultos; 1 de cada 10 niños y adolescentes.

 No existe un tratamiento 100% eficaz frente al NAFLD. El tratamiento más efectivo es la
  pérdida de peso acompañado por el cambio de hábitos alimentarios y la práctica de ejercicio físico.
  Problema asociado a adherencia a dieta y al mantenimiento de pérdida de peso.

 Evidencias científicas recientes indican que la suplementación con determinados ingredientes
  bioactivos combinados (PUFAs, Vite, polifenoles, simbióticos) y determinados patrones dietéticos
  (Dieta Mediterránea) pueden ser efectivos en la prevención y mejora de la NAFLD.
15

                                             Multi-ingrediente frente a NAFLD

                                   betaine

                                                           Hipótesis: La utilización de un multi-ingrediente que
                                                           contenga estos cofactores metabólicos producirá efectos
                                                           beneficiosos frente al NAFLD

                                                              Oxidación de ácidos grasos
                                                                 L-carnitina
                                                                 precursor del NAD+ (Nicotinamide riboside –NR-)

                                                              Estrés oxidativo
                                                                 Precursores de GSH
                                                                       N-acetil-cisteína (NAC)
                                                                       Betaína (dador de grupo metilo)

Mardinoglu A et al. Mol Syst Biol. 2017 Mar; 13(3): 916.           Selección de dos dosis seguras y extrapolables a humanos
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                                  Multi-ingrediente frente a NAFLD

                                 C (n=9)                                       C + VEH
                                                                                                                    n=9
                                                                               HFD + VEH
                                                                                                                   n = 10

                                 HFD                                           HFD + MI_D1
Hamsters                                                                                                           n = 10
 (n=39)
                                                                               HFD + MI_D2                         n = 10

Weeks
           0                                                  8                                               12

        NMR                                                 NMR                                             NMR
                                                                                                                   Sacrifice
                                                       Blood collection
                                                       (TG, CHOL)
                                                                               -   Urine (metabolomics)
                                                                               -   Blood (metabolomics and classical biomarkers)
                                                                               -   Feces
                                                                               -   Liver (metabolomics and transcriptomics)
                                                                               -   Liver histology

               *NMR: Body composition analyses. Lean and fat mass measurements using an EchoMRI-700™ device
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                       Multi-ingrediente frente a NAFLD

                               Control       HFD    HFD+MI_D1             HFD+MI_D2

                                                                Metabolómica

p = 0.03   p = 0.005
                                         p = 0.05
18

                               Multi-ingrediente frente a NAFLD

Análisis transcriptómico

                            80 genes (56 sobre-expresados y 24 inhibidos) y 641
                             genes (268 inhibidos and 373 sobre-expresados) en
                             respuesta al tratamiento con el MI_D1 y MI_D2,
                             respectivamente

                            Las rutas metabólicas más sobre-expresadas en respuesta
                             al MI_D2 son la biosíntesis y el metabolismo de los
                             aminoácidos, incluyendo la glicina, la serina, la treonina, el
                             triptófano, la alanina, el aspartata, el glutamato, la arginina
                             y los BCAAs
19

                                                                 Multi-ingrediente frente a NAFLD                                                 Reporter metabolites
                                                                                                                                                                             Subsystems in
                                                                                                                                                                         iHamsterHepatocyte1818    Up

                                                                                                                                  -log(p-value)

     Construcción del modelo metabólico
                                                                                                        Subsystems in
                                                                             Reporter metabolites   iHamsterHepatocyte1818   Up
              MMR                                 iHamsterHepatocyte1818
                              Hamster orthologs
                               of mouse genes
          8,140 reactions                             3,867 reactions
          3,579 genes                                 1,818 genes
          5,992 metabolites      INIT                 3,205 metabolites
                                Transcriptomics
              HFD                                          Reporter
                                                           metabolite

          HFD+MI_D2

                                                                                                                                                                              Subsystems in
                                                                                                                                                  Reporter metabolites    iHamsterHepatocyte1818   Down

 El tratamiento con el MI activó diferentes rutas metabólicas
  involucradas en el NAFLD, incluyendo el metabolismo de
  aminoácidos, el metabolismo del folato, el ciclo de krebs
  (TCA), la activación de los ácidos grasos y la fosforilación
  oxidativa.
 La suplementación con el MI inhibió los procesos
  metabólicos asociados con la biosíntesis y el metabolismo
  del colesterol, la biosíntesis y la elongación de los ácidos
  grasos y el metabolismo de los nucleótidos.
20

                                                                Multi-ingrediente frente a NAFLD

             Análisis de integración de datos
                                                                                                                                          FAs

                      3-PG[c] PHGDH 3-Pser[c]                                                                                   SLC27A5                  LCT
                                                        Serine[m]                Serine[c]
                      Glucose[c]                                                                                                       FAs pool
                                                 THF[m]                        SHMT1 THF[c]                                                           L-carnitine[c]
                                                             SHMT2                                                                                                                      Mitochondria
                                                               Glycine[m]   Glycine[c]                       VLCFA-CoA               LCFA-CoA                              SCFAs, MCFAs
                                                 Glycine[m]                                                                                                    L-carnitine[m]
                                              SARDH                                                                                                                                 ACSM1
             GNMT                                                                                                                                                                   ACSM3
Glycine[c]          Sarcosine[c]   Sarcosine[m]       5,10-meTHF[m]            5,10-meTHF[c]            ABCD1                         Acylcarnitine[c]             Acylcarnitine[m] ACSM5
                                                                                                                          Shorted FAs                                               ACSS2
                                         DMGDH                                                                                                                                      ACSS3
       SAM[c]    DMG[c]               DMG[c]                                                             VLCFA-CoA               ACOT8
                                                             MTHFD2/L        MTHFD1                                                                                        Acyl-CoA[m] NAD+ [m]     NR
             BHMT2                                                                              NR    NAD+[p]
  Methionine[c] Betaine[c]                                                                                      β-oxidation                                            β-oxidation
                                                                                                                         shortened                                                                ROS
                                                                                                ROS   NADH[p]
                                                                                                                          acyl-CoA                                        Acetyl-CoA[m] NADH[m]
  Homocysteine[c] Betaine                            10-formylTHF[m]          10-formylTHF[c]          Acetyl-CoA[p]               Acylcarnitine[p]
    CBS    Serine[c]                   GSSG[m]
L-cystathionine[c]                            H2O                                                            Peroxisome                                                    NADH[m], ADP[m] NAD+[m], ATP[m]
     CTH                                                     MTHFD1L         MTHFD1                                                                            NAD+[m]
                Glycine[c]                  GPX1/4
    Cysteine[c]                             PRDX5                                                                                                                                    OXPHOS
                                       GSH[m]
                                             H2O2
                                                       Formate[m]                 Formate[c]                                                 ROS
                 GSH[c]
       NAC   GPX1/4                   GSTK1                                                                                            MPV17L, GPX1/4,
             PRDX5                                   Mitochondria                                                                       PRDX5, GSTK1
                        H2O2
           GSSG[c]                      R-S-GSH[m]                          Cytoplasm            Cytoplasm                             ROS metabolism
                       H2O

 La suplementación con el MI (probablemente vía NAC y                                           La suplementación con el MI produjo una sobreexpresión de genes
  betaína) incrementó la expresión de genes involucrados en                                       relacionados con la oxidación de los ácidos grasos y las especies
  el metabolismo de un carbono (ciclo del folato) y en la ruta                                    reactivas de oxígeno (ROS), lo que se relaciona principalmente con
  de trans-sulfuración, relacionadas con la síntesis de GSH                                       la suplementación de la LCT y la NR.
21

                                  Multi-ingrediente frente a NAFLD

Análisis de integración de datos

                        Mitochondria                                                            Valine, leucine and
                                              Alanine[m]                                      isoleucine degradation
                      Glyoxylate[m]                   α-KG[m]                                    BCAT2
                                  Pyruvate[m]      GPT2                                         BCKDHA
                                                                                        MCCC1             ALDH2
                                                                      Glutamine[m]      MCCC2                       PCCA
                                           Glutamate[m]                                                   ALDH9A1
                                                                                         Acetyl-CoA[m]     Propanoyl-CoA[m]
                              HOGA1
                                                     NH3{m} + HCO3-
                                                               CPS1                         OAA[m] Isocitrate[m]
                                                                                                                 M-CoA[m]
                         HOG[m]
                                                 Carbamoyl-phosphate[m]                        TCA cycle IDH2
                                                                                          Malate[m]     α-KG[m]
                                 PRODH                                           Aspartate[m] SDHB Succinate[m]
                       Proline[m]    P5C[m]     Ornithine[m]     Citrulline[m]
                           Arginine and                                      Aspartate[c] α-KG[c]
                        proline metabolism Ornithine[c]       Citrulline[c]                              Alanine[c]
                                                      Urea cycle        ASS1
                                         Urea                                            GOT1            GPT
                                              Arginine[c]   Arginosuccinate[c]
                                                                                     OAA[c] Glutamate[c] Pyruvate[c]
                                                                       Arginine biosynthesis
                         Cytoplasm

                     El tratamiento con el MI produjo una sobreexpresión de genes
                      involucrados en el TCA y el catabolismo de los BCAAs, lo que podría
                      indicar que el MI incrementa la oxidación de ácidos grasos y la
                      respiración celular. También se observó un incremento de genes
                      involucrados en la biosíntesis de arginina y prolina.
22

                                                                  Multi-ingrediente frente a NAFLD

        Conclusión

           Glucose       Betaine                                NAC

                              SLC6A12        Transsulfuration        Glycine, serine, and                                La suplementación con el MI activó el metabolismo
                                                pathway             threonine metabolism
           Glucose[c]                   Hcy[c]                                                                            del NAD+ y GSH y promovió la oxidación de los
                        Betaine[c]                                           GSSG[c]     H2O
                                                            Cysteine[c]                                                   ácidos grasos y el catabolismo de los BCCAs
                                 Methionine[c]           Glycine[c]
           3PG[c]            DMG[c]
                                                                             GSH[c]         ROS
                                        Serine[c]
           3PSer[c]                                  folate metabolism
                                        Serine[m]                                GSSG[m] H2O
                                  DMG[m]
         Pyruvate[c]                                                      GSH[m]
                              Pyruvate[m]               Glycine[m]
                                                                       NADH[m]
                                                                                         ROS
                          BCAAs degradation
BCAAs       BCAAs                                       Acetyl-CoA
        SLC43A1                                                              β-oxidation
                                                     TCA cycle                NAD+[m]              NAD+[c]   NR    NR    La suplementación con el MI atenuó la esteatosis
                                                                      Acyl-CoA                                            hepática inducida por una dieta HF en Golden
                                                      L-carnitine
                                                            Acylcarnitine                                                 Syrian hámster.
                            Mitochondria
                                                                                                                         Nuestros resultados evidencian los efectos
                                                                                                                          beneficiosos de este tratamiento frente a NFLD y
                                                             Acylcarnitine                     β-oxidation                permiten establecer los mecanismos mediante los
                                                                                                             ROS
                                                    L-carnitine       Acyl-CoA     FAs         Peroxisome                 que el MI ejerce sus efectos.
               Cytoplasm

                                                       LCT                         FAs
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                 antoni.caimari@eurecat.org   Red Tecnomifood
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