GRUPO DE ELECTRONALISIS UNIVERSIDAD DE OVIEDO (GEUO)
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GRUPO DE ELECTRONALISIS UNIVERSIDAD DE OVIEDO (GEUO) Ponente: Noemí de los Santos Álvarez/ María Jesús Lobo Castañón Reunión Red de Sensores y Biosensores Electroquímicos ElectroBionet (RED2018-102412-T) 25 de noviembre de 2020 Acciones de dinamización “Redes de Excelencia” 0 1
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo) Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet 12
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo) Química Analítica; Biotecnología DESCRIPCIÓN Desarrollo de biosensores electroquímicos basados en ácidos nucleicos con aplicación en biomedicina. • Desarrrollo de sensores de ADN basados en la reacción de hibridación como proceso de reconocimiento selectivo. Aplicación a la detección de patógenos y diagnóstico molecular. • Selección y caracterización de aptámeros para el reconocimiento de proteína séricas identificadas por su potencial como biomarcadores tumorales. • Desarrollo y validación de biosensores electroquímicos basados en aptámeros para la detección de proteínas en suero. Aplicaciones en diagnóstico. • Combinación de apta- y genoensayos con métodos de amplificación isotérmica de ácidos nucleicos con detección https://www.unioviedo.es/electroanalisis electroquímica. Aplicaciones en diagnóstico clínico, especialmente mjlc@uniovi.es diagnóstico de cáncer. Biosensores electroquímicos; Genosensores; Aptasensores Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet 23
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo) ¿Qué sabemos hacer? Somos expertos en: Selección de aptámeros Imitando la evolución natural en un tubo de ensayo Variabilidad inicial Identificación de las e interacción con secuencias ganadoras diana apropiada • Variabilidad • Selección SELEX • Reproducción Copia de los Separación de los más fuertes más fuertes Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet 34
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo) ¿Qué sabemos hacer? Selección de aptámeros Glicoproteínas Marcadores tumorales Péptidos inmunotóxicos del gluten Dirigiendo la selección • En disolución acuosa hacia un epítopo S. Amaya-González, N. de-los-Santos- Álvarez, A.J. Miranda-Ordieres, M.J. Lobo A. Díaz-Fernández et al. Anal. Chem. 2014, 86, 2733-2739 Biosens. Bioelectron. 2019, • En DES 128, 83. R.Svigelj, N. Dossi, R. Toniolo, R. Miranda- A. Díaz-Fernández et al. Castro, N. de-los-Santos-Álvarez, M.J. Lobo Chem. Sci. 2020, 11, 9402. Angew. Chem. Int. Ed. 2018, 57, 12850. Virus-Like Particles Antibióticos (VLPs) Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet 45
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo) ¿Qué sabemos hacer? Somos expertos en: Selección de aptámeros Diseño de geno- y apta-sensores Sensor Construction 1. Streptavidin ( ) 3. 33-mer-biotin ( ) 2. BSA ( ) 4. biotin ( ) Carbon electrode Competitive Format 1. Competitive step S P 2. Enzyme Biotin-aptamer conjugate ( ) e- Gliadin 3. Enzyme sustrate (S) (analyte) L. López- López, R. Miranda-Castro, N. de-los-Santos-Álvarez, A.J. Miranda- Ordieres, M.J. Lobo-Castañón Sens. Actuators B 2017, 241, 522-527 Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet 56
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo) ¿Qué sabemos hacer? Somos expertos en: Selección de aptámeros Diseño de geno- y apta-sensores H202 H20 TMBred TMBox Sandwich Format Direct Format Gold evaporated electrodes Response range: 4000 0.66 -62 ng/mL 3500 3000 LOD: 0.66 ng/mL 2500 bare gold -Z'' (W) 2000 AuNPs Screen-printed 1500 SAM aptamer electrodes Anti- fluorescein PSA 1000 Fab-POD 500 Biotin- Capture aptamer Streptavidin 0 (recognize rPSA and h PSA) A. Díaz-Fernández et al. 0 500 1000 1500 2000 2500 3000 3500 4000 Z' (W) Fluorescein- Signaling aptamer hPSA Biosens. Bioelectron. 2020 (en revisión) (recognize glycans) A. Díaz-Fernández et al. Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet Biosens. Bioelectron. 2019, 128, 83. 67
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo) ¿Qué sabemos hacer? Somos expertos en: Selección de aptámeros Diseño de geno- y apta-sensores lncRNA (PCA3, cáncer de próstata) Genomic DNA (Salmonella, M. tuberculosis) AuxP TMBred 6FAM-SP TPCA3 TMBox e- Sensing layer onto magnetic beads Personal glucose meter (PGM) antiF-ALP antiFITC-POD R. Miranda Castro et al. Glucose-1- 6-FAM-FP2 Biosensors and Bioelectronics, phosphate 2017, 92, 162-170 . HS-T15-RP Glucose C. Abardía-Serrano et al. Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet Sensors 2020, 20, 5514. 78
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo) ¿Qué sabemos hacer? Somos expertos en: Selección de aptámeros Diseño de geno- y apta-sensores Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos HDA: Helicase Dependent Amplification RPA: Recombinase Polymerase Amplification 4 (A) (B) 3 5 1× 15 6-FAM-FP2 × HS-T15-RP solid phase Target DNA ITO (65 ºC) ITO (65 ºC) recombinase SSB protein 2 polymerase 6 Salmonella genome RP HS-T10-RP3 6-FAM FP2 . polymerase helicase SSB protein 86bp 6-FAM-amplicon 1 S. Barreda-García, R. Miranda-Castro, N. de-los-Santos-Álvarez, A.J. Miranda-Ordieres, R. Sánchez-Salcedo, R. Miranda-Castro, N. de-los-Santos-Álvarez, M.J. M.J. Lobo-Castañón. Chem. Commun. 2017, 53, 9721–9724, Lobo-Castañón. ChemElectroChem 2019, 6, 793–800 Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet 89
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo) ¿Qué sabemos hacer? Somos expertos en: Selección de aptámeros Diseño de geno- y apta-sensores Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos Rolling Circle Amplification (RCA) Phi29 polymerase + + T4 Ligase dNTPs Modified Padlock Aptamer aptamer Elongation TMB Reporter probe TMB ox e- TMB + H 2O 2 R. Lorenzo-Gómez et al. Measuring Antifluorescein Talanta 2019, 197, 406-412 Enzyme Activity Fab- POD Magnetic beads LCN2-2Rt LCN2-2RCA Padlock 6-FAM antiFITC-POD with NGAL aptamer aptamer (RCA template) reporter probe conjugate Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet 9 10
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo) ¿Qué sabemos hacer? Somos expertos en: Selección de aptámeros Diseño de geno- y apta-sensores Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos ¿Qué equipos/infraestructura/conocimiento podemos compartir con la Red? Capacidades del grupo, tecnologías desarrolladas, equipos singulares de laboratorio • Proceso de selección de aptámeros frente a diferentes dianas. • Evaluación de la afinidad de nuevos receptores mediante técnicas que no exigen marcadores: SPR y espectroscopia de impedancias. • Desarrollo de ensayos mixtos, combinando aptámeros con otros receptores. Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet 10 11
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo) Proyectos en curso relacionados con la red • DIAGNOPANC: Nuevas estrategias para la detección temprana del adenocarcinoma ductal de pancreas. Ministerio de Ciencia y Univesidades RTI2018-095756 B- I00. • Desarrollo de nuevas estrategias de detección basadas en sensorses de ADN. Gobierno del Principado de Asturias IDI2018-000217 • Detección de péptidos derivados del gluten basada en aptámeros: aplicación al diagnóstico y seguimiento de la enfermedad celíaca. Asociación de celíacos y sensibles al gluten de la Comunidad de Madrid. XVI Premio de Investigación 2019. Necesidades que tengo para avanzar en mi investigación… Aplicaciones que creo se pueden desarrollar con mi tecnología/conocimiento dentro de la red • Identificación de nuevas moléculas diana (proteínas, secuencias de ácidos nucleicos, metabolitos) de interés en diagnóstico clínico. • Evaluación de marcas alternativas a las enzimas para su acoplamiento a los ácidos nucleicos utilizados como receptors específicos en el desarrollo de los sensores. • Desarrollo de dispositivos microfluídicos en los que puedan integrarse los aptasensores y genosensores desarrollados. Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet 11 12
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