GRUPO DE ELECTRONALISIS UNIVERSIDAD DE OVIEDO (GEUO)

Página creada Roxana Fernandès
 
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GRUPO DE ELECTRONALISIS UNIVERSIDAD DE OVIEDO (GEUO)
GRUPO DE ELECTRONALISIS
           UNIVERSIDAD DE OVIEDO (GEUO)
Ponente: Noemí de los Santos Álvarez/ María Jesús Lobo Castañón

 Reunión Red de Sensores y Biosensores Electroquímicos
           ElectroBionet (RED2018-102412-T)
                             25 de noviembre de 2020
                      Acciones de dinamización “Redes de Excelencia”
                                                                       0
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GRUPO DE ELECTRONALISIS UNIVERSIDAD DE OVIEDO (GEUO)
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo)

                   Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
                                                                                   12
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GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo)
      Química Analítica; Biotecnología
                                                      DESCRIPCIÓN
                                                      Desarrollo de biosensores electroquímicos basados en ácidos
                                                      nucleicos con aplicación en biomedicina.

                                                      • Desarrrollo de sensores de ADN basados en la reacción de
                                                        hibridación como proceso de reconocimiento selectivo. Aplicación a
                                                        la detección de patógenos y diagnóstico molecular.

                                                      • Selección y caracterización de aptámeros para el reconocimiento
                                                        de proteína séricas identificadas por su potencial como
                                                        biomarcadores tumorales.

                                                      • Desarrollo y validación de biosensores electroquímicos basados
                                                        en aptámeros para la detección de proteínas en suero. Aplicaciones
                                                        en diagnóstico.

                                                      • Combinación de apta- y genoensayos con métodos de
                                                        amplificación isotérmica de ácidos nucleicos con detección
https://www.unioviedo.es/electroanalisis                electroquímica. Aplicaciones en diagnóstico clínico, especialmente
mjlc@uniovi.es                                          diagnóstico de cáncer.

                         Biosensores electroquímicos; Genosensores; Aptasensores

                                           Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
                                                                                                                             23
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                               ¿Qué sabemos hacer?
                               Somos expertos en:
                               Selección de aptámeros
               Imitando la evolución natural en un tubo de ensayo
                                 Variabilidad inicial
Identificación de las             e interacción con
secuencias ganadoras              diana apropiada                    • Variabilidad

                                                                     • Selección

                                               SELEX                 • Reproducción
                Copia de los                    Separación de los
                más fuertes                       más fuertes

                               Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
                                                                                               34
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                                ¿Qué sabemos hacer?
                              Selección de aptámeros
  Glicoproteínas
  Marcadores tumorales                                             Péptidos inmunotóxicos
                                                                   del gluten
Dirigiendo la selección                                        •     En disolución acuosa
hacia un epítopo                                              S. Amaya-González, N. de-los-Santos-
                                                              Álvarez, A.J. Miranda-Ordieres, M.J. Lobo
A. Díaz-Fernández et al.                                      Anal. Chem. 2014, 86, 2733-2739
Biosens. Bioelectron. 2019,                                    •     En DES
128, 83.                                                      R.Svigelj, N. Dossi, R. Toniolo, R. Miranda-
A. Díaz-Fernández et al.                                      Castro, N. de-los-Santos-Álvarez, M.J. Lobo
Chem. Sci. 2020, 11, 9402.                                    Angew. Chem. Int. Ed. 2018, 57, 12850.

                                                                   Virus-Like Particles
            Antibióticos                                                 (VLPs)

                                Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
                                                                                                 45
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                            ¿Qué sabemos hacer?
                              Somos expertos en:
                              Selección de aptámeros

                              Diseño de geno- y apta-sensores

        Sensor Construction

                       1. Streptavidin (       )               3. 33-mer-biotin (     )
                           2. BSA (        )                        4. biotin ( )
         Carbon electrode

        Competitive Format
                          1. Competitive step
                                                                                                        S
                                                                                                    P
                                                                       2. Enzyme
                                 Biotin-aptamer
                                                                       conjugate (        )    e-

                                      Gliadin                        3. Enzyme sustrate (S)
                                      (analyte)
                 L. López- López, R. Miranda-Castro, N. de-los-Santos-Álvarez, A.J. Miranda-
                     Ordieres, M.J. Lobo-Castañón Sens. Actuators B 2017, 241, 522-527

                             Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
                                                                                                            56
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                                                          ¿Qué sabemos hacer?
                                                          Somos expertos en:
                                                          Selección de aptámeros

                                                          Diseño de geno- y apta-sensores
                           H202        H20
                         TMBred          TMBox     Sandwich Format                      Direct Format
                                                                            Gold evaporated electrodes

                                                 Response range:                                                       4000

                                                  0.66 -62 ng/mL                                                       3500

                                                                                                                       3000
                                                 LOD: 0.66 ng/mL
                                                                                                                       2500

                                                                                                                                                                                           bare gold

                                                                                                            -Z'' (W)
                                                                                                                       2000
                                                                                                                                                                                           AuNPs

 Screen-printed                                                                                                        1500
                                                                                                                                                                                           SAM
                                                                                                                                                                                           aptamer
 electrodes                                           Anti- fluorescein                                                                                                                    PSA
                                                                                                                       1000
                                                      Fab-POD
                                                                                                                       500

                         Biotin- Capture aptamer          Streptavidin                                                   0
                         (recognize rPSA and h PSA)                       A. Díaz-Fernández et al.
                                                                                                                              0   500   1000   1500   2000     2500   3000   3500   4000
                                                                                                                                                      Z' (W)
                         Fluorescein- Signaling aptamer       hPSA        Biosens. Bioelectron. 2020 (en revisión)
                         (recognize glycans)

A. Díaz-Fernández et al.                                  Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
Biosens. Bioelectron. 2019, 128, 83.
                                                                                                                                                                                      67
GRUPO DE ELECTRONALISIS UNIVERSIDAD DE OVIEDO (GEUO)
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo)
                                       ¿Qué sabemos hacer?
                                           Somos expertos en:
                                           Selección de aptámeros

                                           Diseño de geno- y apta-sensores

           lncRNA (PCA3, cáncer de próstata)                         Genomic DNA (Salmonella, M. tuberculosis)

                                                AuxP                                           TMBred
                                 6FAM-SP
                                            TPCA3                                           TMBox
                                                                                       e-
Sensing layer onto
 magnetic beads
           Personal glucose
             meter (PGM)                               antiF-ALP                     antiFITC-POD
                                                                                                    R. Miranda Castro et al.
                    Glucose-1-                                                         6-FAM-FP2    Biosensors and Bioelectronics,
                    phosphate                                                                       2017, 92, 162-170 .
                                                                                      HS-T15-RP
                      Glucose
   C. Abardía-Serrano et al.               Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
   Sensors 2020, 20, 5514.
                                                                                                                         78
GRUPO DE ELECTRONALISIS UNIVERSIDAD DE OVIEDO (GEUO)
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo)
                                                         ¿Qué sabemos hacer?
          Somos expertos en: Selección de aptámeros
                             Diseño de geno- y apta-sensores
                                         Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos
                 HDA: Helicase Dependent Amplification                                   RPA: Recombinase        Polymerase                   Amplification

                                                                                                                            4
    (A)                                          (B)                                               3
                                                                                                                                                       5

     1×
     15                                                                                                                      6-FAM-FP2
     ×
                                                                                                                              HS-T15-RP

                                                                                                                    solid phase
                                                                                                                           Target DNA

                 ITO (65 ºC)                                   ITO (65 ºC)                                       recombinase SSB protein
                                                                                             2                            polymerase                    6
           Salmonella genome          RP          HS-T10-RP3          6-FAM FP2                             .
            polymerase     helicase        SSB protein                      86bp
                                                                       6-FAM-amplicon                               1

S. Barreda-García, R. Miranda-Castro, N. de-los-Santos-Álvarez, A.J. Miranda-Ordieres,      R. Sánchez-Salcedo, R. Miranda-Castro, N. de-los-Santos-Álvarez, M.J.
M.J. Lobo-Castañón. Chem. Commun. 2017, 53, 9721–9724,                                      Lobo-Castañón. ChemElectroChem 2019, 6, 793–800

                                                          Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
                                                                                                                                                            89
GRUPO DE ELECTRONALISIS UNIVERSIDAD DE OVIEDO (GEUO)
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo)
¿Qué sabemos hacer?
Somos expertos en:
Selección de aptámeros
Diseño de geno- y apta-sensores

Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos
                        Rolling Circle Amplification (RCA)
                                                             Phi29 polymerase
                                           +                        +
                                       T4 Ligase                  dNTPs
       Modified                        Padlock                   Aptamer
       aptamer                                                  Elongation

                              TMB
                                                                                                        Reporter
                                                                                                        probe
                              TMB ox
                         e-

                                    TMB + H 2O 2
                                                                                                     R. Lorenzo-Gómez et al.
                                   Measuring                  Antifluorescein
                                                                                                     Talanta 2019, 197, 406-412
                                 Enzyme Activity                Fab- POD

       Magnetic beads     LCN2-2Rt     LCN2-2RCA       Padlock          6-FAM         antiFITC-POD
         with NGAL         aptamer       aptamer    (RCA template)   reporter probe     conjugate

                                           Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
                                                                                                                                  9
                                                                                                                                  10
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo)
                                      ¿Qué sabemos hacer?
                                        Somos expertos en:
                                        Selección de aptámeros
                                        Diseño de geno- y apta-sensores
                                        Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos

                                      ¿Qué equipos/infraestructura/conocimiento
                                      podemos compartir con la Red?
Capacidades del grupo, tecnologías desarrolladas, equipos singulares de
laboratorio

• Proceso de selección de aptámeros frente a diferentes
  dianas.
• Evaluación de la afinidad de nuevos receptores mediante
  técnicas que no exigen marcadores: SPR y espectroscopia
  de impedancias.

• Desarrollo de ensayos mixtos, combinando aptámeros con
  otros receptores.
                                       Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
                                                                                                       10
                                                                                                       11
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo)

                                Proyectos en curso relacionados con la red
                              • DIAGNOPANC: Nuevas estrategias para la detección temprana del
                                adenocarcinoma ductal de pancreas. Ministerio de Ciencia y Univesidades
                                RTI2018-095756 B- I00.

                              • Desarrollo de nuevas estrategias de detección basadas en sensorses de ADN.
                                Gobierno del Principado de Asturias IDI2018-000217

                              • Detección de péptidos derivados del gluten basada en aptámeros: aplicación al
                                diagnóstico y seguimiento de la enfermedad celíaca. Asociación de celíacos y
                                sensibles al gluten de la Comunidad de Madrid. XVI Premio de Investigación 2019.

Necesidades que tengo para avanzar en mi investigación…
Aplicaciones que creo se pueden desarrollar con mi tecnología/conocimiento dentro de la red

        • Identificación de nuevas moléculas diana (proteínas, secuencias de ácidos
          nucleicos, metabolitos) de interés en diagnóstico clínico.

        • Evaluación de marcas alternativas a las enzimas para su acoplamiento a los ácidos
          nucleicos utilizados como receptors específicos en el desarrollo de los sensores.

        • Desarrollo de dispositivos microfluídicos en los que puedan integrarse los
          aptasensores y genosensores desarrollados.

                                     Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
                                                                                                             11
                                                                                                             12
GEUO (Grupo Electronálisis Universidad de Oviedo)

                   Red de sensores y biosensores electroquímicos - ElectroBionet
                                                                                   12
                                                                                   13
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