Procedimientos en Microbiología Clínica - Seimc
←
→
Transcripción del contenido de la página
Si su navegador no muestra la página correctamente, lea el contenido de la página a continuación
Procedimientos en Microbiología Clínica Recomendaciones de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica Editores: Emilia Cercenado y Rafael Cantón Coordinador: Carlos Sánchez Carrillo Autores: Carmen Guerrero Gómez Carlos Sánchez Carrillo ISBN: 84-609-2287-1 I
INDICE INDICE DEL DOCUMENTO CIENTIFICO 1. Introducción 2. Consideraciones clínicas 3. Recogida y transporte de las muestras 4. Toma de muestras 5. Recepción y procesamiento de las muestras en el laboratorio de microbiología INDICE DEL DOCUMENTO TÉCNICO 1. PROPÓSITO Y ALCANCE 2. FUNDAMENTO 3. DOCUMENTOS DE CONSULTA 4. MUESTRAS 4.1.Criterios de aceptación y rechazo de las muestras/toma de decisiones 4.2.Mantenimiento de muestras tras el procesamiento 4.3.Transporte de muestras por superficie y por vía aérea 4.3.1. Transporte internacional aéreo 4.3.2. Transporte nacional y local por superficie 5. MEDIOS DE CULTIVO, REACTIVOS Y PRODUCTOS 6. APARATOS Y MATERIAL 7. PROCESAMIENTO 7.1 Recepción de la muestra 7.2. Procesamiento de la muestra 7.2.1. Pretratamiento de la muestra 7.2.1.1.Centrifugación 7.2.1.2. Homogeneización 7.2.1.2.1 Mediante hoja de bisturí 7.2.1.2.2. Mediante mortero 7.2.1.2.3. Mediante Stomacher 7.2.2. Preparación de extensiones 7.2.2.1. Mediante impronta: piezas de tejido 7.2.2.2. Extensiones finas: material muy purulento 7.2.2.3. Líquidos 7.2.2.4. Muestras en torunda 7.2.3. Inoculación de la muestra en los medios de cultivo 7.2.3.1. Piezas no triturables 7.2.3.2. Muestras recibidas en jeringas o tubos estériles 7.2.3.3. Muestras recibidas en torundas 7.2.3.4. Técnica de Maki para cultivo de catéteres intravasculares 7.2.3.5. Cultivos semicuantitativos 7.2.3.6. Cultivos cuantitativos 7.2.4. Incubación 7.2.4.1. Temperatura 7.2.4.2. Atmósferas de incubación 8. OBTENCIÓN Y EXPRESIÓN DE RESULTADOS 9. RESPONSABILIDADES 10. ANOTACIONES AL PROCEDIMIENTO 11. LIMITACIONES DEL PROCEDIMIENTO 12. BIBLIOGRAFÍA II
Procedimientos en Microbiología Clínica Recomendaciones de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica Editores: Emilia Cercenado y Rafael Cantón 1a. RECOGIDA, TRANSPORTE Y PROCESAMIENTO GENERAL DE LAS MUESTRAS EN EL LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA 2003 Coordinador: Carlos Sánchez Carrillo Autores: Carmen Guerrero Gómez Carlos Sánchez Carrillo 1
DOCUMENTO CIENTÍFICO 1. INTRODUCCIÓN 3. RECOGIDA Y TRANSPORTE DE LAS MUESTRAS La actividad que desarrolla el laboratorio de Toda la información diagnóstica que puede microbiología está orientada esencialmente al generar el laboratorio de microbiología depende en diagnóstico microbiológico de las enfermedades gran medida de la muestra enviada. Esta no sólo infecciosas. Una parte importante de esa actividad tiene que ser la adecuada, sino que además debe consiste en el aislamiento, la identificación y la cumplir unos requisitos que aseguren su idoneidad y determinación de la sensibilidad a los antimicrobianos de en consecuencia la calidad de nuestro trabajo. La los microorganismos causales de estas enfermedades. idoneidad de las muestras enviadas depende del Otra parte importante de la actividad de un laboratorio cumplimiento de una serie de medidas o reglas de microbiología consiste en la detección de referentes a: procedimiento de obtención, cantidad anticuerpos, antígenos y ácidos nucleicos en diversas enviada y transporte rápido y adecuado al muestras (sangre, líquidos estériles, orina, etc.), técnicas laboratorio. Todas las normas y recomendaciones que resultan muy útiles en el diagnóstico precoz de sobre estos aspectos se encuentran detalladas en el determinadas enfermedades infecciosas. La gran documento técnico. Las consecuencias de una diversidad de muestras clínicas y de métodos muestra mal tomada y/o mal enviada pueden diagnósticos aplicables, son dos aspectos que suponer un fracaso en el aislamiento del agente diferencian el laboratorio de microbiología de otros etiológico o el aislamiento de posibles laboratorios clínicos. microorganismos contaminantes que pueden generar Este documento pretende exponer de forma tratamientos innecesarios o inadecuados. Para resumida los aspectos referentes a la recogida, asegurar la idoneidad de las muestras que recibe, el transporte y procesamiento de las muestras que son laboratorio de microbiología debe elaborar un relevantes para que la actividad del laboratorio de manual claro y conciso de las normas de recogida y microbiología se desarrolle de manera eficaz y eficiente. transporte de las mismas. Dicho manual debe Los aspectos relacionados con las pruebas rápidas de distribuirse en controles de enfermería, consultas y detección de anticuerpos, antígenos y ácidos nucleicos demás dependencias hospitalarias y ambulatorias en no se describen en el presente procedimiento y serán las que se asista a los pacientes. desarrollados en otros posteriores. 4. TOMA DE MUESTRAS 2. CONSIDERACIONES CLÍNICAS La explicación detallada de la toma de cada El primer paso del diagnóstico microbiológico muestra para el diagnóstico microbiológico se puede comienza con la obtención de la muestra clínica encontrar en cada procedimiento concreto de la adecuada. Para ello es preciso conocer los posibles SEIMC. En estos se detallará la preparación previa agentes etiológicos de las enfermedades infecciosas del paciente, la muestra de elección, las alternativas y los mecanismos patogénicos de los mismos. La aceptables, su cantidad, los recipientes adecuados y muestra debe ser representativa del proceso la conservación de la muestra así como su infeccioso que se pretende diagnosticar, teniendo estabilidad. siempre en cuenta que en determinadas infecciones, muestras no relacionadas directamente con la 5. RECEPCIÓN Y PROCESAMIENTO DE LAS focalidad clínica pueden tener también un buen MUESTRAS EN EL LABORATORIO DE rendimiento microbiológico. El síndrome clínico y los MICROBIOLOGÍA posibles agentes etiológicos implicados condicionan Una vez que la muestra se recibe en el laboratorio no sólo el tipo de muestra a enviar sino también su de microbiología, el manejo de la misma incluye: procedimiento de obtención y el transporte al 1. Recepción de la muestra: consiste básicamente en laboratorio. En la tabla 1 se resumen los distintos determinar si la muestra cumple o no los requisitos tipos de muestras adecuadas en función de las de calidad necesarios para ser procesada. Estos infecciones más comunes. Igualmente, la requisitos incluyen: la correcta identificación de la información clínica es la que permite al laboratorio muestra, la valoración sobre si existe una cantidad aplicar las técnicas diagnósticas disponibles de adecuada para el estudio solicitado y la manera más eficiente. Por ello es fundamental que el comprobación de las condiciones adecuadas de microbiólogo esté en estrecha comunicación con los transporte y conservación. Cada laboratorio debe clínicos y que participe activamente en el proceso elaborar y distribuir los criterios de aceptación y diagnóstico del paciente. A su vez, el laboratorio de rechazo de las muestras. microbiología debe poner a disposición de los clínicos toda la información necesaria sobre las posibilidades diagnósticas que el laboratorio ofrece. Para ello, debe elaborar y distribuir la cartera de servicios disponible. 2
Tabla 1.- Muestras clínicas recomendadas para el diagnóstico microbiológico de las infecciones más comunes Tipo de infección Muestra Comentarios Bacteriemia Hemocultivos Infecciones cardiovasculares y asociadas a dispositivos intravasculares (IV) Endocarditis Hemocultivos/Válvula/Verrugas Infección del catéter Catéter IV, piel pericatéter, conexión del catéter Pericarditis Líquido pericárdico Sistema nervioso central Meningitis LCR Abscesos cerebrales Aspirados de abscesos Tracto respiratorio Faringoamigdalitis Exudado faríngeo Sinusitis Aspirado sinusal No válidos los exudados nasales Otitis media Timpanocentesis Otitis externa Exudado oído externo Neumonía Esputo, muestras obtenidas por fibrobroncoscopia, punción transtorácica aspirativa, punción transtraqueal, broncoaspirado Empiema y abscesos pulmonares Líquido pleural, aspirados de abscesos Nasofaríngeo Diagnóstico tosferina/Infecc. víricas Nasal Detección de S. aureus Infecciones oculares Conjuntivitis Exudado conjuntival/raspado Queratitis Raspado corneal Endoftalmitis Líquido intraocular Infecciones gastrointestinales Diarrea Heces/biopsia intestinal/ Aspirado duodenal Infecciones intraabdominales Peritonitis Líquido peritoneal Abscesos intraperitoneales y Aspirados de abscesos abscesos viscerales Colecistitis Líquido biliar Tracto urinario Infección urinaria Orina (micción media, sonda) Orina obtenida mediante punción Diagnóstico de bacteriuria por suprapúbica anaerobios y de ITU en niños Tracto genital Úlceras genitales Raspado de la úlcera Nódulos genitales Aspirado del nódulo Uretritis Exudado uretral Vulvovaginitis Exudado vaginal Detección de S.agalactiae (también Cervicitis Exudado endocervical exudado rectal) Prostatitis Secreción prostática Acompañada de orina pre y post masaje prostático Piel y tejidos blandos Impétigo, foliculitis, erisipela, celulitis, Preferiblemente aspirados úlceras, infecciones gangrenosas, tomados con jeringa y biopsias de abscesos cutáneos, heridas y tejido. Son menos recomendables quemaduras las muestras tomadas con torundas Hueso y articulaciones Artritis Líquido sinovial Osteomielitis Biopsia ósea o exudado LCR: Líquido cefalorraquídeo 3
2. Procesamiento: consiste en la preparación de las Aunque el aislamiento por cultivo, continúa siendo muestras, la realización de tinciones y la una las técnicas más frecuentemente empleadas inoculación en los medios de cultivo para su en el diagnóstico de las enfermedades infecciosas, posterior incubación. En este proceso es preciso existen en la actualidad otras técnicas cuya considerar: a) el tipo de muestra enviada, b) el principal ventaja sobre el cultivo es la rapidez diagnóstico clínico del paciente y c) la petición diagnóstica. Estas técnicas de diagnóstico rápido solicitada. se basan en la detección de antígenos y de ácidos El tipo de muestra enviada determina si nucleicos o en la detección de la respuesta requiere o no pretratamiento (centrifugación, inmunológica. Si bien la detección de ácidos homogeneización) previo a la inoculación de los nucleicos no está al alcance de todos los medios de cultivo. laboratorios, las técnicas de detección de La información clínica del paciente es antígenos no requieren tecnología ni equipos fundamental para la selección de los medios de especiales y son fáciles de realizar. Las técnicas cultivo a inocular y su posterior incubación. más utilizadas son la inmunofluorescencia directa, De modo general, en función del tipo de la aglutinación con partículas de látex, el muestra, el laboratorio utiliza unos medios de enzimoinmunoensayo y la inmunocromatografía. cultivo primarios que permiten el aislamiento de la Otras técnicas de diagnóstico rápido basadas en la mayoría de los agentes etiológicos más frecuentes detección de la respuesta inmunológica de los distintos procesos infecciosos. Sin embargo, (anticuerpos principalmente) han demostrado ser en ocasiones el síndrome clínico puede estar muy útiles en el diagnóstico de determinadas causado por microorganismos poco frecuentes enfermedades infecciosas. Las técnicas más cuyo aislamiento requiere el uso de medios de utilizadas son el Rosa de Bengala (para el cultivo específicos y/o selectivos no habituales. La diagnóstico de la brucelosis) y la detección de sospecha de la participación de alguno de estos anticuerpos heterófilos (para el diagnóstico de la microorganismos poco habituales, debe mononucleosis infecciosa), el RPR (para el comunicarse al laboratorio. Igualmente, el diagnóstico de la sífilis), y la detección rápida laboratorio debe dar a conocer a los clínicos de su presuntiva de infección por el VIH. En la actualidad institución qué microorganismos investiga existen múltiples equipos comercializados para la rutinariamente y cuáles debe especificar en la detección de numerosos microorganismos en petición (cartera de servicios o catálogo de determinadas muestras clínicas (ver tabla 2) que pruebas). han demostrado utilidad. 4
Tabla 2.- Microorganismos con técnica rápida disponible para su detección en muestras clínicas Microorganismos Muestras Técnicas disponibles Bacterias a Haemophilus influenzae tipo b LCR Aglutinación b Streptococcus pneumoniae LCR, orina, muestras Aglutinación (LCR), IC (orina) respiratorias Neisseria meningitidis LCR Aglutinación c d Legionella pneumophila Muestras respiratorias, orina IFD (respiratorias), IC, EIA (orina) Streptococcus pyogenes Exudado faríngeo, lesiones IC cutáneas, líquidos estériles Brucella spp. Sangre Aglutinación Clostridium difficile Heces Aglutinación, EIA Hongos Aspergillus spp. Suero Inmunodifusión, EIA Cryptococcus neoformans Suero Inmunodifusión, EIA Pneumocystis jiroveci Muestras respiratorias IFD Virus Rotavirus Heces IC, Aglutinación Adenovirus Heces, muestras IC (heces, respiratorias), Aglutinación respiratorias (heces), IFD (respiratorias) Virus respiratorio sincitial Muestras respiratorias IC, IFD Virus influenza Muestras respiratorias IC, IFD Virus parainfluenza Muestras respiratorias IFD Virus de la inmunodeficiencia Sangre IC, EIA humana Virus herpes simplex Lesiones cutáneas IFD Virus varicella zoster Lesiones cutáneas/muestras IFD respiratorias Citomegalovirus Sangre/muestras IFD respiratorias/orina Virus Epstein Barr Sangre Aglutinación Parásitos Cryptosporidium Heces Tinción de ácido-alcohol resistencia Plasmodium Sangre Giemsa, Gota gruesa, IC Giardia + Cryptosporidium Heces IFD Entamoeba histolytica Heces EIA a b c d Abreviaturas: LCR: Líquido cefalorraquídeo; IC: Inmunocromatografía; IFD: Inmunofluorescencia directa; EIA: Enzimo inmunoensayo 5
DOCUMENTO TÉCNICO PNT-RTP-01 RECOGIDA, TRANSPORTE Y PROCESAMIENTO GENERAL DE LAS MUESTRAS EN EL LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA ELABORADO REVISADO Y APROBADO Jefe de Servicio Nombre/Firma Fecha Nombre/Firma Fecha EDICIÓN FECHA ALCANCE MODIFICACIONES 01 Primera edición COPIA REGISTRADA Nº.......... ASIGNADA A....................................................................................... Este documento es propiedad del Servicio de Microbiología del Hospital .......………………. .................. La información en él contenida no podrá reproducirse total ni parcialmente sin autorización escrita del Responsable de su elaboración. Las copias no registradas no se mantienen actualizadas a sus destinatarios.
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 2 de 20 1. PROPÓSITO Y ALCANCE una escasa cantidad de muestra puede ser la El propósito de este procedimiento es establecer las causa de falsos negativos. directrices para asegurar la calidad de la fase 6. El material destinado a cultivo no debe estar en preanalítica en lo que afecta tanto a la recogida contacto con sustancias desinfectantes o como al transporte de las muestras hasta la llegada anestésicas, siempre que sea posible. al laboratorio de microbiología previo al 7. La muestra se debe recoger, siempre que sea procesamiento. Asimismo, este procedimiento posible, antes de iniciar cualquier terapia establece las directrices del procesamiento inicial de antimicrobiana. la muestra de una manera general, una vez recibida 8. Se debe evitar, siempre que sea posible, el en el laboratorio. contacto de la muestra con microbiota normal del paciente, con el objeto de asegurar que la muestra Este procedimiento es aplicable a todos los laboratorios refleje lo mejor posible el lugar de la infección. de hospitales, centros de salud o cualquier laboratorio 9. El envío al laboratorio de microbiología debe ser lo que realice determinaciones de microbiología clínica. más rápido posible con objeto de asegurar la supervivencia de microorganismos de difícil 2. FUNDAMENTO crecimiento y de evitar el sobrecrecimiento de la Todo el trabajo de un laboratorio de microbiología se microbiota normal, acortar el tiempo de contacto convierte en inútil si las muestras clínicas que se con anestésicos locales o con otras sustancias reciben para el diagnóstico no son de calidad, es decir, con acción antimicrobiana utilizadas en la recogida no están correctamente recogidas y transportadas al de la muestra. laboratorio en las condiciones adecuadas para la determinación que se solicita. El laboratorio de microbiología debe proporcionar esta información a los servicios solicitantes para que tanto la recogida como el transporte y la conservación se hagan de manera apropiada. 3. DOCUMENTOS DE CONSULTA - Seguridad en el laboratorio de microbiología clínica (Procedimiento 10). Procedimientos en microbiología clínica. Recomendaciones de la SEIMC. Coordinadora Elena Loza Fernández de Bobadilla. 2000. - Procedimientos específicos para cada tipo de técnica. 4. MUESTRAS En la tabla 3 se puede consultar con más detalle la muestra de elección para cada determinación microbiológica, recipientes, transporte y conservación de cada muestra. Como reglas generales cabe indicar las siguientes: 1. Antes de recoger la muestra, considerar el riesgo/beneficio de la recogida de la muestra para el paciente. 2. La muestra debe transportarse en envases adecuados con cierres a prueba de fugas (ver tablas 4 y 5). La recogida de la muestra deberá realizarse en condiciones de máxima asepsia, evitando contaminaciones ambientales del personal y del propio enfermo a la muestra y viceversa. 3. La muestra debe etiquetarse con el nombre del paciente, el servicio solicitante, el tipo de muestra y la fecha de recogida. En determinados casos será importante precisar la hora de recogida. 4. Se recomienda que cada muestra se introduzca en una bolsa de plástico que a su vez se introducirá en otra donde se incluya el volante. Así se evita que los posibles derrames de la muestra invaliden el volante de petición. 5. Se debe recoger una cantidad de muestra adecuada a la petición (ver tabla 6). En ocasiones
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 3 de 20 Tabla 3.- Transporte y conservación de muestras para diagnóstico microbiológico Muestra Determinación Envases TRANSPORTE CONSERVACIÓN Tiempo y temperatura Tiempo y temperatura Abscesos/heridas Bacterias Envase para anaerobios (pref.) o jeringa sin aguja (pref.) ≤2 h, TA ≤24 h, TA quemaduras/mordeduras Una para Gram, otra para cultivo (Amies/Stuart) Hongos Estéril (pref.)/Torunda ≤2 h, TA ≤24 h, TA Una torunda para tinción, otra para cultivo (Amies/Stuart) Virus Torunda seca1 Transferir a TV, +24 h, -60/-80ºC ≤24 h, 2-8°C Biopsias Bacterias/Hongos Estéril ≤15 min, TA ≤24 h, TA Virus Estéril Transferir a TV, +24 h, -60/-80ºC ≤24 h, 2-8°C Catéter/material Bacterias/Hongos Estéril ≤15 min, TA ≤24 h, 2-8°C protésico Catéter urinario No es aceptable Catéter drenaje No se recomienda Enviar líquido drenaje/abscesos/aspirados Genital Bacterias/Hongos Estéril ≤2 h, TA ≤24 h, TA (Secreción prostática) Genital (cervical/ Chlamydia trachomatis Medio transporte clamidia (cultivo) Inoculación inmediata uretral/rectal Torunda seca (fluorescencia) Genital (cervical/rectal/ Bacterias (gonococo) Inoculación directa sobre medios de cultivo uretral) Torunda con medio transporte ≤2 h, TA ≤24 h, TA Genital (líq. amniótico) Bacterias/Hongos Transporte de anaerobios ≤15 min, TA ≤24 h, TA Genital (úlcera) Virus Torunda seca1 Transferir a TV, +24 h, -60/-80ºC (cualquier localización) ≤24 h, 2-8°C Genital (semen) No se recomienda Genital (úlcera) Treponema pallidum Campo oscuro Inmediata visualización (cualquier localización) Genital (Uretral) Mycoplasma hominis Torunda de dacrón Inocular a medio transporte ≤8 h, TA Ureaplasma urealyticum de mycoplasmas ≤36 h, 2-8°C Genital (vaginal) Bacterias/Hongos Torunda con medio transporte (cultivo) ≤2 h, TA ≤24 h, TA Torunda seca para Gram Heces Bacterias Estéril con Cary Blair ≤2 h, TA ≤24 h, 2-8°C
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 4 de 20 Muestra Determinación Envases TRANSPORTE CONSERVACIÓN Tiempo y temperatura Tiempo y temperatura Clostridium difficile Estéril ≤1 h, TA 48 h, 2-8°C para cultivo 1-24 h, 2-8°C 72 h, 2-8°C (citotoxina) >24 h, -20°C +72 h, -60/-80°C (citotoxina) Parásitos Transporte con SAF, FOR + PVA, MIF + PVA Indefinido, TA Indefinido, TA Rotavirus Estéril 2-8°C Heces/Rectal Virus Torunda seca1 Transferir a TV, +24 h, ºC ≤24 h, 2-8°C Jugo gástrico Bacterias/Hongos Estéril ≤2 h, 2-8°C ≤24 h, 2-8°C Micobacterias Estéril ≤15 min, TA o neutralizar ≤24 h, 2-8°C en la 1ª hora de la recogida Lesiones fúngicas Hongos Inoculación directa sobre medios de cultivo ≤24 h, TA (piel, pelo, uñas) Líquidos Bacterias Estéril/botellas de hemocultivos ≤15 min, TA ≤24 h, TA estériles transporte para anaerobios Hongos Estéril ≤15 min, TA ≤24 h, 2-8°C Virus Estéril ≤15 min, 2-8°C ≤72 h, 2-8°C Serología Estéril ≤15 min, TA ≤24 h, 2-8°C Parásitos Estéril ≤15 min, TA ≤24 h, TA Médula ósea Bacterias/Hongos Estéril/botellas de hemocultivos ≤24 h, TA ≤24 h, TA Parásitos (Leishmania) Estéril ≤2 h, TA ≤2 h, TA Virus Estéril Transferir a TV, +24 h, -60/-80ºC ≤24 h, 2-8°C Ocular (Conjuntival) Bacterias/Hongos Torunda con medio de transporte ≤2 h, TA ≤24 h, TA Ocular (Raspado corneal) Bacterias/Hongos Inoculación directa en medios de cultivo ≤15 min, TA ≤24 h, TA Ocular Virus Torunda seca1 Transferir a TV, +24 h, -60/-80ºC ≤24 h, 2-8°C Oído externo Bacterias/Hongos Torunda con medio de transporte ≤2 h, TA ≤24 h, 2-8°C Oído interno Bacterias/Hongos Torunda con medio de transporte ≤2 h, TA ≤24 h, TA Transporte para anaerobios Tubo estéril
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 5 de 20 Tabla 3.- Continuación Muestra Determinación Envases TRANSPORTE CONSERVACIÓN Tiempo y temperatura Tiempo y temperatura Orina Bacterias/Hongos Estéril ≤2 h, TA (sin conservante) ≤24 h, 2-8°C Tubos con conservante (ác. bórico-formiato sódico) ≤24 h, 2-8°C (con conservante) Virus Estéril ≤24 h, 2-8°C M. hominis/ Estéril Inocular en medio transporte ≤8 h, TA U. urealyticum de micoplasma ≤36 h, 2-8°C Leptospira Estéril ≤1 h, TA Parásitos Estéril ≤2 h, TA ≤24 h, 2-8°C Antígeno Legionella Estéril ≤2 h, TA ≤24 h, TA ≤24, 2-8°C +14 d, -20°C Antígeno de neumococo Estéril ≤2 h, TA ≤24 h, TA ≤24, 2-8°C +14 d, -20°C Orina suprapúbica Bacterias Transporte para anaerobios ≤2 h, TA ≤24 h, 2-8°C Rectal Bacterias Torunda con medio de transporte ≤2 h, TA ≤24 h, TA Sangre Hemocultivo Botellas de hemocultivos ≤2 h, TA ≤24 h, TA Serología Suero ≤24 h, 2-8°C +24h, -20°C Plasma (no válido si hay que inactivar) +24h, -60/-80°C (evitar descongelación) Virus Plasma ≤2 h, TA (con EDTA para técnicas moleculares) Carga vírica VIH Plasma (nunca heparina) ≤2 h, TA ≤72 h, -20-°C +72h, -60/-80°C Cultivo Leishmania Sangre no coagulada (con heparina pref.) ≤15 min, TA Parásitos Sangre no coagulada (con EDTA) ≤15 min, TA
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 6 de 20 Tabla 3.- Continuación Muestra Determinación Envases TRANSPORTE CONSERVACIÓN Tiempo y temperatura Tiempo y temperatura Tracto respiratorio Bacterias Transporte para anaerobios/Estéril ≤15 min, TA ≤24 h, TA superior (sinusal) Hongos Estéril Tracto respiratorio Bacterias/Hongos Torunda con medio de transporte ≤2 h, TA ≤24 h, TA superior (faríngeo) Tracto respiratorio Antígeno S. pyogenes Torunda seca (Dacrón/algodón) ≤2 h, TA ≤72 h, 2-8°C superior (faríngeo) Virus Torunda seca1 Transferir a TV, +24 h, -60/-80ºC ≤24 h, 2-8°C Tracto respiratorio Bacterias/Hongos Torunda con medio de transporte ≤2 h, TA ≤24 h, TA superior (nasal) Bacterias/Hongos Torunda con medio de transporte ≤2 h, TA ≤24 h, TA Virus Torunda seca1 Transferir a TV, +24 h, -60/-80ºC ≤24 h, 2-8°C Tracto respiratorio Bordetella pertussis Torunda seca de alginato Inmediato/2-8°C superior (nasofaríngeo) Tracto respiratorio Bacterias/Hongos Estéril ≤2 h, TA ≤24 h, 2-8°C Inferior2/esputo Virus Estéril Transferir a TV, +24 h, -60/-80ºC ≤24 h, 2-8°C 1 Para virus: Se aceptan torundas de algodón, dacrón o rayón con bastón de aluminio o plástico. No aceptar torundas de alginato o con bastón de madera. 2Muestras del tracto respiratorio inferior: aspirado bronquial, lavado broncoalveolar, cepillado por telescopado, aspirado traqueal, punción transtorácica aspirativa con aguja ultrafina. Abreviaturas: TA: temperatura ambiente, TV: medio de transporte de virus; SAF: acetato sódico-formalina, FOR: 10% formalina, MIF: mertiolato-ioduro-formalina; pref.: preferentemente.
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 7 de 20 Tabla 4.- Sistemas de transporte para la investigación de microorganismos aerobios Sistema de transporte Comentarios Torundas con medio de transporte Torundas en tubos de plástico con medio de transporte que mantiene un pH favorable y previene la desecación de la muestra. Torundas de alginato cálcico Útiles para la investigación de Chlamydia spp. y Bortedetella spp. Pueden ser tóxicas para N.gonorrhoeae, U. urealyticum y virus útiles para la toma de muestra de conexiones de catéteres intravasculares. Torundas de dacrón Útiles para la investigación de virus Torundas de algodón Pueden inhibir a Chlamydia spp. Cuando la torunda es de madera, puede inactivar a virus del grupo Herpes e interferir con las pruebas de identificación de Ureaplasma. Torundas para exudados nasofaríngeos Torundas flexibles que emplean alambre en lugar de varilla de madera Tubos estériles de boca ancha Útiles para el transporte de orinas, esputos, broncoaspirados, lavados broncoalveolares, heces, biopsias. Tubos estériles Líquidos estériles, catéter telescopado, aspirados de abscesos y heridas Tubos estériles con medio de transporte o Tubo estéril con medio de transporte (Cary Blair) para conservante enteropatógenos en heces. Tubo con fijador (alcohol polivinílico) para parásitos en heces. Tubo con conservante (ácido bórico–formiato de sodio) para orinas. Mantiene la población bacteriana durante 48h a temperatura ambiente sin necesidad de refrigeración. Placas de Petri estériles Útiles para pelos, escamas cutáneas y uñas Tabla 5.- Sistemas de transporte para la investigación de microorganismos anaerobios Sistema de transporte Comentarios Torundas con sistemas de transporte específicos para anaerobios Viales y tubos con atmósfera anaerobia Contienen un medio de transporte semisólido con un agente reductor y un indicador. Cualquier coloración azul de dicho medio indica exposición al aire. Bolsas de anaerobiosis La muestra se introduce en el interior de una bolsa impermeable en cuyo interior se introduce un catalizador y un generador de hidrógeno y CO2. Jeringa para la obtención de aspirados Cuando no se dispone de ninguno de los sistemas anteriores o bien la cantidad de muestra es mínima, puede utilizarse la misma jeringa con la que se ha obtenido. Para ello hay que eliminar el aire y taponar la aguja con un tapón de goma.
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 8 de 20 Tabla 6.- Consideraciones sobre la toma de las muestras 1. Consideraciones sobre la toma de las muestras del sistema nervioso central Volumen mínimo Cultivo Comentarios recomendado (ml) Bacterias 1 Enviar el tubo mas turbio Hongos 2 Descartar Cryptococcus spp. Micobacterias 2 Anaerobios 2 Abscesos y biopsias Parásitos 2 Abscesos o biopsias. Naegleria spp. y Acantamoeba spp. también en LCR. Virus 1-2 2.- Consideraciones sobre los líquidos estériles Cultivo Volumen (ml) Comentarios Bacterias 1-5 Especificar sospecha de artritis gonocócica Hongos > 10 Micobacterias > 10 Anaerobios 1-5 Usar un medio de transporte con anaerobiosis 3.- Consideraciones sobre las muestras del tracto respiratorio Cultivo Volumen (ml) Comentarios Bacterias No aplicable Especificar sospecha de Legionella Hongos 3-5 Esputos, broncoscopias, aspirados y biopsias pulmonares Pneumocystis jiroveci 2 Esputo inducido, lavado broncoalveolar o biopsia pulmonar Micobacterias 5-10 Esputo, broncoscopia, aspirados y biopsias pulmonares Anaerobios 1 Aspirado sinusal, timpanocentesis, aspirados y biopsias pulmonares Parásitos 3-5 Amebas, huevos de helmintos, larvas de Echinococcus, Ascaris y Strongyloides spp. 4. Consideraciones sobre las muestras oculares Cultivo Comentarios Bacterias Inocular los medios directamente Hongos Inocular los medios directamente Micobacterias No usar torundas Anaerobios Líquido intraocular Parásitos Descartar Acantamoeba spp. Chlamydia No usar torundas de algodón Virus No usar torundas de alginato cálcico
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 9 de 20 Tabla 6.- Continuación 5. Consideraciones sobre las muestras gastrointestinales Cultivo Comentarios Bacterias Heces Biopsia gástrica: Helicobacter pylori Torunda rectal: Patógenos entéricos (especialmente Shigella spp.) y Neisseria gonorrhoeae. Hongos Jugo gástrico, biopsia gástrica, biopsia esofágica Micobacterias Jugo gástrico, biopsia gástrica, heces Parásitos Jugo duodenal (Giardia spp y Strongyloides stercoralis) Biopsia rectal: Entamoeba histolytica Biopsias intestino delgado: Giardia spp. Cryptosporidium y Microsporidium spp. Virus Biopsia esofágica (CMV y Herpes) y biopsia rectal (Herpes). 6.- Consideraciones sobre las muestras de orina Cultivo Volumen (ml) Comentarios Bacterias 0,5-1 No válidas orinas de 24 horas Hongos > 20 No válidas orinas de 24 horas Micobacterias > 20 No válidas orinas de 24 horas Anaerobios 1 Sólo en orinas suprapúbicas Parásitos Orina de 24 Schistosoma haematobium, Trichomonas horas vaginalis, Onchocerca volvulus Virus 10-50 No válidas orinas de 24 horas. Adenovirus y CMV 7.- Consideraciones sobre las muestras del tracto genital y enfermedades de transmisión sexual. Cultivo Muestra recomendada Neisseria gonorrhoeae Cervical, uretral, anal Bacterias Cervical, vaginal, secreción prostática Trichomonas vaginalis Vaginal, secreción prostática Hongos Anal, vaginal, cervical Anaerobios Abscesos Virus Herpes Úlceras genitales Chlamydia trachomatis Uretral, vulva, cervical Treponema pallidum Úlceras genitales Ureaplasma urealyticum Uretra, secreción prostática Linfogranuloma venéreo Rectal, cervical, uretral, úlceras genitales Haemophilus ducreyi Úlceras y nódulos genitales 8.- Consideraciones sobre las muestras de piel y tejidos blandos Cultivo Comentarios Bacterias Usar aspirados con jeringas o biopsias de tejido preferiblemente Hongos Dermatofitos, levaduras, filamentosos y hongos dimórficos Micobacterias Mycobacterium marinum, Mycobacterium fortuitum y Mycobacterium chelonae Anaerobios Poco comunes en infecciones superficiales, investigar sobre todo en mordeduras y traumas Virus Virus herpes simplex y varicella zoster
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 10 de 20 4.1. CRITERIOS DE ACEPTACIÓN Y RECHAZO DE muestras en formol), no se aceptarán estas muestras LAS MUESTRAS/TOMA DE DECISIONES y se informará al servicio solicitante de la inadecuación El laboratorio de microbiología debe determinar, una vez de la muestra. recibida la muestra en el laboratorio, si ésta cumple con los requisitos para ser procesada. Estos requisitos 4.2. MANTENIMIENTO DE MUESTRAS TRAS EL incluyen entre otros, una correcta identificación, tipo de PROCESAMIENTO muestra adecuada para la petición, y condiciones Es recomendable mantener las muestras conservadas adecuadas de transporte y conservación. Es necesario (dependiendo de la muestra/petición: a temperatura que cada laboratorio establezca y difunda a los servicios ambiente, en estufa de 35-37°C, en nevera de 2-8°C, o peticionarios sus propios requisitos de la aceptación de congeladas a -20°C ó a –70°C) un tiempo tras su una muestra para estudio microbiológico. procesamiento. El tiempo de conservación debe ser aquel que garantice que un problema en el El laboratorio de microbiología debe disponer también procesamiento o en la interpretación de los cultivos de un sistema de registro de estas incidencias en el que pueda ser solucionado recuperando la muestra para un figure la muestra implicada, la persona que realiza la nuevo procesamiento. El tiempo mínimo oscila entre 1-3 recepción de la muestra, el tipo de incidencia, la persona días. Se recomienda guardar tanto las muestras con la que se contacta del servicio solicitante y la procesadas como las rechazadas (no procesadas). resolución de la incidencia (si la muestra no se procesa, si finalmente se decide su procesamiento y en qué 4.3. TRANSPORTE DE MUESTRAS POR condiciones, etc.). Como sugerencia se podía utilizar el SUPERFICIE Y POR VÍA AÉREA formato del Anexo 1, Registro de incidencias en la Cada vez es más frecuente la realización de recepción de las muestras. procedimientos microbiológicos en lugares distantes al de la toma de muestra. Aunque es obvio que las Las incidencias más frecuentes en la llegada de una muestras biológicas, sean infecciosas o no, deben muestra al laboratorio de microbiología y las acciones a estar correctamente empaquetadas y etiquetadas realizar (toma de decisiones) ante cada caso son las para su transporte y envío, se ha hecho necesario el siguientes: desarrollo de legislaciones o guías específicas, tanto - Muestra deficientemente identificada: no se a nivel nacional como internacional, debido al aceptará una muestra sin identificar, mal aumento del transporte de muestras fuera de los identificada o en la que no coincidan la recintos hospitalarios y entre los distintos centros identificación del volante de petición con la de la sanitarios. El objetivo de este desarrollo es el reducir muestra. En cualquier caso se contactará con el al mínimo posible el riesgo de accidentes. servicio peticionario haciéndole conocer la 4.3.1.- Transporte internacional aéreo. Las necesidad de que procedan a la correcta regulaciones internacionales para el transporte de identificación de la muestra. Si se puede recoger material infeccioso están basadas en las otra muestra, se solicitará nuevamente. Recomendaciones del Comité de Expertos de las Dependiendo de la importancia de la muestra, se Naciones Unidas para el Transporte de Artículos puede optar a su procesamiento antes de la Peligrosos. Estas recomendaciones están incluidas correcta identificación con el objeto de que no se en las regulaciones de la Unión Postal Universal deteriore la misma. (UPU), La Organización Internacional de Aviación - Muestras derramadas: no se aceptarán muestras (OIAC) y la Asociación Internacional de Transporte claramente derramadas y se solicitará una nueva Aéreo (IATA), todas ellas asesoradas por la OMS. muestra. Se procederá como en el caso anterior solicitando una nueva muestra. En el caso de no ser Actualmente, las muestras se clasifican en posible la recogida de una nueva muestra, desinfectar sustancias infecciosas (clasificadas dentro de uno externamente el envase o trasvasar la muestra a un de los cuatro grupos de riesgo definidos por la OMS) contenedor estéril. En este caso, se indicará en el y en muestras para diagnóstico. informe que la muestra estaba derramada y que los resultados deben ser interpretados con la debida La modificación en enero de 2003 de la clasificación precaución. de una muestra como muestra para diagnóstico - Transporte/conservación inadecuados: si no se permite que las que cumplan este criterio puedan ser cumplen los requisitos de la tabla 3, se solicitará clasificadas como ONU 3373 y embaladas según las nueva muestra. En el caso de muestras que no se instrucciones de embalaje 650 del manual de la puedan volver a recoger (por ejemplo: muestras IATA, con las siguientes excepciones: quirúrgicas) se puede optar por procesarlas - patógenos del grupo 4 de riesgo. informando por escrito al servicio solicitante de la - Agentes identificados y patógenos nuevos o incidencia en la recogida/transporte de la muestra y emergentes. alertando de que los resultados obtenidos deben ser - Cultivos o “stocks” en grandes concentraciones. interpretados con la precaución correspondiente. En el En los tres casos anteriores los envíos deberán caso de que el transporte deficiente invalide seguir siendo clasificados bajo ONU 2814 ó 2900 y totalmente el estudio microbiológico (por ejemplo,
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 11 de 20 embalados de acuerdo con la instrucción del 6. Normas para envío con refrigerantes (dióxido de embalaje 602 de IATA. carbono y nitrógeno líquido). 7. Ejemplos de formato de los documentos de envío Sistema básico de embalaje (ver figura 1). Se (los originales pueden obtenerse de la compañía compone de: transportadora). 4.3.2.- Transporte nacional y local por superficie. Recipiente primario estanco, a prueba de Otras posibilidades de transporte de material filtraciones, etiquetado, que contiene la muestra. El biológico incluyen el traslado de muestras dentro de recipiente debe envolverse en material absorbente. un hospital o centro, de un centro de salud a un hospital, de un laboratorio a otro, de un hospital a Recipiente secundario estanco, a prueba de otro dentro de la misma ciudad o a otra ciudad. Estos filtraciones, que encierra y protege el recipiente servicios de entrega deben ser gestionados por el primario. Se pueden colocar varios recipientes propio hospital, por el servicio de salud o por primarios envueltos en un recipiente secundario. Se cualquier organización de transportes o agencia que debe usar suficiente material absorbente para haya sido autorizada. proteger a todos los recipientes primarios y evitar choques entre ellos. Los principios en los que se basa un transporte seguro son los mismos que se aplican para el Recipiente externo de envío. El recipiente transporte internacional y la finalidad es que la secundario se coloca en un paquete de envío que muestra no tenga ninguna posibilidad de salir del protege al recipiente secundario y su contenido de embalaje en las circunstancias normales de los elementos externos, tales como daño físico y transporte. agua, mientras se encuentra en tránsito. Para el embalaje y transporte de material biológico Los formularios con datos, cartas y otras en estas situaciones (transporte local por superficie) informaciones de identificación de la muestra deben se recomienda un embalaje tipo, como el envase colocarse pegados con cinta adhesiva en el exterior homologado de la figura 1 y se deben tener en del recipiente secundario. cuenta las siguientes indicaciones: Para el transporte de sustancias infecciosas se debe 1. Los recipientes de las muestras deben ser utilizar el sistema de embalaje básico con herméticos y a prueba de fugas de líquidos. requerimientos específicos de etiquetado y 2. Si el recipiente es un tubo, debe estar cerrado documentación. herméticamente, con tapa de rosca y colocado en una gradilla, de tal forma que mantenga su En los vuelos internacionales está estrictamente posición vertical. prohibido que los pasajeros transporten sustancias 3. Los recipientes con muestras y gradillas deben infecciosas con ellos o en su equipaje de mano. colocarse en una caja resistente de metal o Igualmente está prohibida la utilización del correo plástico y a prueba de fugas de líquido, que diplomático para el transporte de este tipo de contenga una cubierta segura y que cierre material. perfectamente. 4. La caja donde se transportan los materiales deberá La Guía para el transporte de sustancias infecciosas ser asegurada firmemente en el vehículo de y especímenes diagnósticos, publicada por la OMS transporte. en 1997, permite un conocimiento detallado de los 5. Cada caja de transporte deberá estar etiquetada requerimientos específicos para las diferentes de forma adecuada y de acuerdo a su contenido. situaciones que se pueden plantear ante el envío de 6. Los formularios con los datos de identificación de material biológico, algunos de los cuales se plantean los especímenes deben acompañar a cada caja de a continuación: transporte. 7. El vehículo de transporte deberá ir provisto de 1. Cantidad de sustancias infecciosas que pueden material absorbente, desinfectantes, un contenedor enviarse en un paquete. para desechos a prueba de fugas líquidas y 2. Tipos de etiquetas de riesgo para sustancias guantes resistentes de uso múltiple. infecciosas y para microorganismos genéticamente El transporte de material biológico requiere una modificados. buena colaboración entre el remitente, la compañía 3. Tipos de etiquetas de riesgo para microorganismos de transporte y el destinatario, y cada uno debe no infecciosos. asumir sus responsabilidades para garantizar que el 4. Etiquetas para envío con dióxido de carbono (hielo producto llega a su destino oportunamente y en seco). buenas condiciones. 5. Información que debe figurar en la etiqueta.
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 12 de 20 Figura 1.- Sistema básico de embalaje 5. MEDIOS DE CULTIVO, REACTIVOS Y rango de aceptación, anotar la incidencia y realizar las PRODUCTOS acciones frente a esa variación. Estas acciones, por un Los medios de cultivo y reactivos recomendados para lado, deben asegurar los resultados derivados de los el procesamiento de muestras se detallan en la tabla cultivos y por otro corregir esa desviación. 7. Las condiciones de almacenamiento (temperatura, humedad, etc.) de los reactivos y medios de cultivo De una manera genérica se sugieren los siguientes utilizados deben ser establecidas, controladas y intervalos de aceptación: revisadas (ver más detalles en el apartado 6). • estufas de 35-37°C se acepta una mínima superior o igual a 34°C y máxima inferior o igual a 37,5°C Se deben realizar, con periodicidad (semanal, mensual, • estufas de 42°C se aceptan variaciones entre 40-43°C trimestral, etc.) establecida por el propio laboratorio, una • estufas de 30°C se aceptan variaciones entre 28-32ºC revisión de los materiales almacenados (cantidad, Para las neveras el intervalo de tolerancia que se acepta caducidades, estado general) con el fin de comprobar el es generalmente de 2º-8°C, aunque puede variar en estado de los mismos, verificando su correcta ubicación función de los reactivos que contengan. en los espacios identificados y definidos para ellos en el almacén y su aptitud para el uso (ver como ejemplo de Todos los termómetros utilizados en la medida de formato el del Anexo 2, Revisión de almacén). temperaturas de los aparatos se han de verificar mediante un termómetro de referencia calibrado. Se 6. APARATOS Y MATERIAL introducirá el termómetro utilizado para la medición de la Los equipos habituales necesarios en el procesamiento temperatura y el termómetro calibrado en el equipo de una muestra para estudio microbiológico son: correspondiente (nevera, congelador o estufa) durante - Estufas - Congeladores un mínimo de 15 minutos. Se aceptarán aquellos - Neveras - Centrífugas termómetros cuyos desvíos no sobrepasen los límites establecidos para cada uso concreto. La periodicidad de De manera periódica (preferiblemente a diario) debe la verificación de los termómetros con el termómetro controlarse la temperatura (y humedad/presión de CO2 calibrado debe ser establecida por el propio laboratorio. si fuera necesario) de cada estufa/nevera/congelador al inicio de la jornada de trabajo con un termómetro Existen sistemas automáticos para el control de la situado permanentemente en el centro de cada equipo. temperatura, humedad, presión de CO2, etc., que El termómetro debe permitir la medida de la temperatura controlan de una manera permanente (en intervalos de máxima y mínima alcanzadas. Se anotará en la hoja de 15-20 minutos) los anteriores parámetros con gran registro de temperatura de cada aparato (como ejemplo fiabilidad y que utilizan sondas de referencia verificadas se propone la del Anexo 3, Registro de temperatura) y por organismos certificados. Estos sistemas alertan de en el caso de temperaturas mínima o máxima fuera del los desvíos que se producen de una manera más rápida
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 13 de 20 Tabla 7.- Recomendaciones de medios de cultivo y tinción de Gram para muestras microbiológicas seleccionadas Muestras/Microorganismo Gram AS ACH MCK Tio/BHI Otros 1 Biopsias X X X X X Medios anaerobios Biopsias (intestinal, colon, rectal) C.difficile Enteropatógenos Biopsias gástricas X Helicobacter pylori Catéter vascular X Conexiones/Piel pericatéter X Genitales Rectal X S. agalactiae Uretral X X Thayer Martin Cervical X X Thayer Martin Secreción prostática X X X X Vaginal X S. agalactiae Heces Caldo Selenito, SS o similar Campylobacter selectivo Sangre ampicilina 1 Heridas profundas, mordeduras, X X X X X Medios anaerobios quemaduras, úlceras, abscesos Heridas superficiales X X X X X 1 Jugo gástrico X X X X Medios anaerobios Líquidos estériles 1 L. ascítico, peritoneal, X X X X X Medios anaerobios pericárdico, sinovial L. pleural X X X X X BCYE 1 Medios anaerobios Líquido cefalorraquídeo X X X X Ocular Exudado conjuntival X X 1 L. intraocular X X X X X Medios anaerobios Oído externo X X X Timpanocentesis X X X X X Orina (micción, sondaje) X X Agar Cled 1 Orina suprapúbica X X X X Medios anaerobios Tracto respiratorio inferior Broncoaspirado X X X X BCYE Cepillado bronquial con X X X X BCYE 1 telescopado Medios anaerobios Lavado broncoalveolar X X X X BCYE Esputo X X X X Tracto respiratorio superior 1 Aspirado sinusal X X X X X Medios anaerobios Faríngeo X Alternativa CNA Nasal X Agar Manitol sal Clostridium difficile CCFA E.coli O157H7 Sorbitol-MCK Bordetella pertussis Bordet Gengou IFD si no cultivo Helicobacter pylori X Agar Helicobacter Thayer Martin Agar Brucella Legionella BYCE Neisseria gonorrhoeae X Thayer Martin Streptococcus agalactiae X Todd-Hewitt Agar Granada Vibrio TCBS Yersinia CIN 1: medios anaerobios: agar sangre para anaerobios (Brucella agar), agar feniletanol para anaerobios. agar sangre lacada-vancomicina-kanamicina (ASKVL), agar Bacteroides bilis esculina (BBE) Abreviaturas: AS: Agar sangre; ACH: Agar chocolate; MCK: Agar MacConkey; Tio/BHI: Caldo tioglicolato ó infusión cerebro-corazón de buey; BCYE: agar enriquecido para cultivo de Legionella; CNA: agar sangre colistina-ácido nalidíxico; CCFA: agar cicloserina-cefoxitina-fructosa-yema de huevo; TCBS: agar tiosulfato-citrato-sales biliares-sacarosa; CIN: agar cefsulodina-irgasán-novobiocina
Servicio de Microbiología Recogida, transporte y Fecha: procesamiento general de muestras PNT-RPT-01 Hospital........................... en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01 Página 14 de 20 que el control manual, controlan todos los equipos del - Traspasar la muestra al interior de un mortero laboratorio y generan los informes de estos estéril y añadir 1-2 ml de caldo de cultivo parámetros. - Con ayuda de la mano del mortero triturar la 7. PROCESAMIENTO muestra mediante movimientos rotatorios 7.1. RECEPCIÓN DE LA MUESTRA - Traspasar la muestra utilizando una pipeta Cada laboratorio de microbiología debe disponer Pasteur estéril a un contendor estéril de unas normas de recepción y aceptación de 7.2.1.2.3. Mediante Stomacher muestras para diagnóstico microbiológico. En el acto - Colocar la muestra en el interior de una bolsa de la aceptación de muestras por el laboratorio se de Stomacher y añadir 1-2 ml de caldo de deben comprobar los siguientes aspectos: cultivo - La trazabilidad, es decir, la correspondencia de la - Colocar la bolsa en el interior del Stomacher, muestra con el volante de petición (con el dejando unos centímetros de la bolsa paciente). En la petición se debe incluir: sobresalir sobre la tapa del Stomacher. - Nombre completo del paciente, número de - Cerrar la tapa y conectar el Stomacher durante historia o de la seguridad social o DNI 1 a 5 minutos. - Servicio solicitante, nombre del médico - Desconectar el Stomacher, extraer la bolsa y solicitante traspasar su contenido a un contenedor estéril. - Tipo de muestra (descripción completa y Las muestras que se procesen para hongos no se método de obtención) homogenizan sino que se deben cortar en pequeños - Hora y/o fecha de recogida trozos con la ayuda del bisturí y se inoculan - Enfermedad de base y motivo de la petición directamente sobre los medios de hongos con objeto - El correcto transporte de la muestra para la de evitar que determinados hongos no septados petición solicitada sean inviables. - La petición correcta de determinaciones 7.2.2.- Preparación de extensiones microbiológicas 7.2.2.1. Mediante impronta: Piezas de tejido - Colocar el tejido en una placa de Petri y cortar 7.2. PROCESAMIENTO DE LA MUESTRA una porción con la ayuda de una hoja de bisturí El laboratorio someterá a la muestra a un - Con unas pinzas, tomar la pieza cortada y procesamiento en función de sus protocolos de realizar impresiones por la superficie del corte trabajo y de la información que aporta el servicio sobre un portaobjetos solicitante sobre la muestra y el paciente. Así el 7.2.2.2. Extensiones finas: material muy procesamiento dependerá de varios factores: purulento • Petición del servicio solicitante - Tomar una porción de la muestra y colocarla • Tipo de muestra/técnica de obtención sobre un portaobjetos • Diagnóstico del paciente/enfermedad de base - Colocar otro portaobjetos sobre la muestra y • Motivo de petición presionar los dos portaobjetos • Cualquier otra información aportada en el volante - Desplazar el portaobjetos superior sobre el de la petición que contiene la muestra hasta separarlos De una manera general podemos considerar estos - Repetir este último paso hasta conseguir una tipos de procesamiento de las muestras para extensión fina microbiología de la siguiente forma: 7.2.2.3. Líquidos 7.2.1.- Pretratamiento de la muestra - Depositar una gota de líquido sobre un 7.2.1.1. Centrifugación portaobjetos y dejar secar - Centrifugar todos los líquidos en volumen - Citocentrifugar unas gotas de líquido 5-10 superior a 1ml a 2.500 rpm durante 15 minutos min. a velocidad media - Centrifugar sangre a 3.500 rpm durante 3-5 minutos para detección de antígenos y/o 7.2.2.4. Muestras en torunda anticuerpos - Colocar la torunda sobre un portaobjetos - Otras técnicas de concentración específicas: - Añadir sobre la torunda una pequeña precipitación en etanol, ultracentrifugación cantidad de caldo de cultivo selectiva, etc. - Realizar movimientos rotatorios, exprimiendo 7.2.1.2. Homogeneización la torunda sobre el portaobjetos 7.2.1.2.1 Mediante hoja de bisturí 7.2.3. Inoculación de la muestra en los medios de - Traspasar la muestra a una placa de Petri cultivo: selección de los medios: (ver tabla 7) estéril. Con ayuda de una hoja de bisturí 7.2.3.1. Piezas no triturables desmenuzar el tejido hasta obtener una Si la pieza es pequeña, introducirla en un caldo consistencia homogénea. de cultivo e incubar 24 horas tras lo cual se - Traspasar la muestra homogenizada a un harán subcultivos a los medios necesarios. contenedor estéril con ayuda de una pipeta - Si la muestra es grande, añadir al contenedor Pasteur. en el que se recibe 10-20 ml de caldo de 7.2.1.2.2. Mediante mortero enriquecimiento e incubar inmediatamente.
También puede leer