Procedimientos en Microbiología Clínica - Seimc

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Procedimientos en Microbiología Clínica

Recomendaciones de la Sociedad Española de Enfermedades
                Infecciosas y Microbiología Clínica

         Editores: Emilia Cercenado y Rafael Cantón

     Coordinador: Carlos Sánchez Carrillo
     Autores:     Carmen Guerrero Gómez
                Carlos Sánchez Carrillo

                                                 ISBN: 84-609-2287-1

                                                                       I
INDICE
INDICE DEL DOCUMENTO CIENTIFICO
1. Introducción
2. Consideraciones clínicas
3. Recogida y transporte de las muestras
4. Toma de muestras
5. Recepción y procesamiento de las muestras en el laboratorio de microbiología

INDICE DEL DOCUMENTO TÉCNICO
1. PROPÓSITO Y ALCANCE
2. FUNDAMENTO
3. DOCUMENTOS DE CONSULTA
4. MUESTRAS
       4.1.Criterios de aceptación y rechazo de las muestras/toma de decisiones
       4.2.Mantenimiento de muestras tras el procesamiento
       4.3.Transporte de muestras por superficie y por vía aérea
           4.3.1. Transporte internacional aéreo
           4.3.2. Transporte nacional y local por superficie
5. MEDIOS DE CULTIVO, REACTIVOS Y PRODUCTOS
6. APARATOS Y MATERIAL
7. PROCESAMIENTO
       7.1 Recepción de la muestra
       7.2. Procesamiento de la muestra
                7.2.1. Pretratamiento de la muestra
                         7.2.1.1.Centrifugación
                         7.2.1.2. Homogeneización
                                  7.2.1.2.1 Mediante hoja de bisturí
                                  7.2.1.2.2. Mediante mortero
                                  7.2.1.2.3. Mediante Stomacher
                7.2.2. Preparación de extensiones
                         7.2.2.1. Mediante impronta: piezas de tejido
                         7.2.2.2. Extensiones finas: material muy purulento
                         7.2.2.3. Líquidos
                         7.2.2.4. Muestras en torunda
                7.2.3. Inoculación de la muestra en los medios de cultivo
                     7.2.3.1. Piezas no triturables
                         7.2.3.2. Muestras recibidas en jeringas o tubos estériles
                         7.2.3.3. Muestras recibidas en torundas
                         7.2.3.4. Técnica de Maki para cultivo de catéteres
                         intravasculares
                         7.2.3.5. Cultivos semicuantitativos
                         7.2.3.6. Cultivos cuantitativos
                7.2.4. Incubación
                         7.2.4.1. Temperatura
                         7.2.4.2. Atmósferas de incubación
8. OBTENCIÓN Y EXPRESIÓN DE RESULTADOS
9. RESPONSABILIDADES
10. ANOTACIONES AL PROCEDIMIENTO
11. LIMITACIONES DEL PROCEDIMIENTO
12. BIBLIOGRAFÍA

                                                                                     II
Procedimientos en Microbiología Clínica
        Recomendaciones de la Sociedad Española de Enfermedades
                    Infecciosas y Microbiología Clínica
              Editores: Emilia Cercenado y Rafael Cantón

1a. RECOGIDA, TRANSPORTE Y PROCESAMIENTO GENERAL DE LAS
MUESTRAS EN EL LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA 2003

                     Coordinador: Carlos Sánchez Carrillo

                          Autores: Carmen Guerrero Gómez
                                   Carlos Sánchez Carrillo

                                                                  1
DOCUMENTO CIENTÍFICO

1. INTRODUCCIÓN                                                3. RECOGIDA Y TRANSPORTE DE LAS MUESTRAS
    La actividad que desarrolla el laboratorio de                   Toda la información diagnóstica que puede
microbiología está orientada esencialmente al                  generar el laboratorio de microbiología depende en
diagnóstico microbiológico de las enfermedades                 gran medida de la muestra enviada. Esta no sólo
infecciosas. Una parte importante de esa actividad             tiene que ser la adecuada, sino que además debe
consiste en el aislamiento, la identificación y la             cumplir unos requisitos que aseguren su idoneidad y
determinación de la sensibilidad a los antimicrobianos de      en consecuencia la calidad de nuestro trabajo. La
los microorganismos causales de estas enfermedades.            idoneidad de las muestras enviadas depende del
Otra parte importante de la actividad de un laboratorio        cumplimiento de una serie de medidas o reglas
de microbiología consiste en la detección de                   referentes a: procedimiento de obtención, cantidad
anticuerpos, antígenos y ácidos nucleicos en diversas          enviada y transporte rápido y adecuado al
muestras (sangre, líquidos estériles, orina, etc.), técnicas   laboratorio. Todas las normas y recomendaciones
que resultan muy útiles en el diagnóstico precoz de            sobre estos aspectos se encuentran detalladas en el
determinadas enfermedades infecciosas. La gran                 documento técnico. Las consecuencias de una
diversidad de muestras clínicas y de métodos                   muestra mal tomada y/o mal enviada pueden
diagnósticos aplicables, son dos aspectos que                  suponer un fracaso en el aislamiento del agente
diferencian el laboratorio de microbiología de otros           etiológico    o    el    aislamiento  de    posibles
laboratorios clínicos.                                         microorganismos contaminantes que pueden generar
    Este documento pretende exponer de forma                   tratamientos innecesarios o inadecuados. Para
resumida los aspectos referentes a la recogida,                asegurar la idoneidad de las muestras que recibe, el
transporte y procesamiento de las muestras que son             laboratorio de microbiología debe elaborar        un
relevantes para que la actividad del laboratorio de            manual claro y conciso de las normas de recogida y
microbiología se desarrolle de manera eficaz y eficiente.      transporte de las mismas. Dicho manual debe
Los aspectos relacionados con las pruebas rápidas de           distribuirse en controles de enfermería, consultas y
detección de anticuerpos, antígenos y ácidos nucleicos         demás dependencias hospitalarias y ambulatorias en
no se describen en el presente procedimiento y serán           las que se asista a los pacientes.
desarrollados en otros posteriores.
                                                               4. TOMA DE MUESTRAS
2. CONSIDERACIONES CLÍNICAS                                        La explicación detallada de la toma de cada
     El primer paso del diagnóstico microbiológico             muestra para el diagnóstico microbiológico se puede
comienza con la obtención de la muestra clínica                encontrar en cada procedimiento concreto de la
adecuada. Para ello es preciso conocer los posibles            SEIMC. En estos se detallará la preparación previa
agentes etiológicos de las enfermedades infecciosas            del paciente, la muestra de elección, las alternativas
y los mecanismos patogénicos de los mismos. La                 aceptables, su cantidad, los recipientes adecuados y
muestra debe ser representativa del proceso                    la conservación de la muestra así como su
infeccioso que se pretende diagnosticar, teniendo              estabilidad.
siempre en cuenta que en determinadas infecciones,
muestras no relacionadas directamente con la                   5. RECEPCIÓN Y PROCESAMIENTO DE LAS
focalidad clínica pueden tener también un buen                    MUESTRAS EN EL LABORATORIO DE
rendimiento microbiológico. El síndrome clínico y los             MICROBIOLOGÍA
posibles agentes etiológicos implicados condicionan            Una vez que la muestra se recibe en el laboratorio
no sólo el tipo de muestra a enviar sino también su            de microbiología, el manejo de la misma incluye:
procedimiento de obtención y el transporte al                  1. Recepción de la muestra: consiste básicamente en
laboratorio. En la tabla 1 se resumen los distintos               determinar si la muestra cumple o no los requisitos
tipos de muestras adecuadas en función de las                     de calidad necesarios para ser procesada. Estos
infecciones    más     comunes.     Igualmente,     la            requisitos incluyen: la correcta identificación de la
información clínica es la que permite al laboratorio              muestra, la valoración sobre si existe una cantidad
aplicar las técnicas diagnósticas disponibles de                  adecuada para el estudio solicitado y la
manera más eficiente. Por ello es fundamental que el              comprobación de las condiciones adecuadas de
microbiólogo esté en estrecha comunicación con los                transporte y conservación. Cada laboratorio debe
clínicos y que participe activamente en el proceso                elaborar y distribuir los criterios de aceptación y
diagnóstico del paciente. A su vez, el laboratorio de             rechazo de las muestras.
microbiología debe poner a disposición de los
clínicos toda la información necesaria sobre las
posibilidades diagnósticas que el laboratorio ofrece.
Para ello, debe elaborar y distribuir la cartera de
servicios disponible.

                                                                                                                          2
Tabla 1.- Muestras clínicas recomendadas para el diagnóstico microbiológico de las
infecciones más comunes
Tipo de infección                              Muestra                             Comentarios
Bacteriemia
                                               Hemocultivos
Infecciones cardiovasculares y
 asociadas a dispositivos
 intravasculares (IV)
Endocarditis                                   Hemocultivos/Válvula/Verrugas
Infección del catéter                          Catéter IV, piel pericatéter,
                                               conexión del catéter
Pericarditis                                   Líquido pericárdico
Sistema nervioso central
Meningitis                                     LCR
Abscesos cerebrales                            Aspirados de abscesos
Tracto respiratorio
Faringoamigdalitis                             Exudado faríngeo
Sinusitis                                      Aspirado sinusal                    No válidos los exudados nasales
Otitis media                                   Timpanocentesis
Otitis externa                                 Exudado oído externo
Neumonía                                       Esputo, muestras obtenidas por
                                               fibrobroncoscopia, punción
                                               transtorácica aspirativa, punción
                                               transtraqueal, broncoaspirado
Empiema y abscesos pulmonares                  Líquido pleural, aspirados de
                                               abscesos
                                               Nasofaríngeo                        Diagnóstico tosferina/Infecc. víricas
                                               Nasal                               Detección de S. aureus
Infecciones oculares
Conjuntivitis                                  Exudado conjuntival/raspado
Queratitis                                     Raspado corneal
Endoftalmitis                                  Líquido intraocular
Infecciones gastrointestinales
Diarrea                                        Heces/biopsia intestinal/
                                               Aspirado duodenal
Infecciones intraabdominales
Peritonitis                                    Líquido peritoneal
Abscesos intraperitoneales y                   Aspirados de abscesos
abscesos viscerales
Colecistitis                                   Líquido biliar
Tracto urinario
Infección urinaria                             Orina (micción media, sonda)
                                               Orina obtenida mediante punción     Diagnóstico de bacteriuria por
                                               suprapúbica                         anaerobios y de ITU en niños

Tracto genital
Úlceras genitales                              Raspado de la úlcera
Nódulos genitales                              Aspirado del nódulo
Uretritis                                      Exudado uretral
Vulvovaginitis                                 Exudado vaginal                     Detección de S.agalactiae (también
Cervicitis                                     Exudado endocervical                exudado rectal)
Prostatitis                                    Secreción prostática                Acompañada de orina pre y post
                                                                                   masaje prostático
Piel y tejidos blandos
Impétigo, foliculitis, erisipela, celulitis,   Preferiblemente aspirados
úlceras, infecciones gangrenosas,              tomados con jeringa y biopsias de
abscesos cutáneos, heridas y                   tejido. Son menos recomendables
quemaduras                                     las muestras tomadas con
                                               torundas
Hueso y articulaciones
Artritis                                       Líquido sinovial
Osteomielitis                                  Biopsia ósea o exudado
LCR: Líquido cefalorraquídeo

                                                                                                                           3
2. Procesamiento: consiste en la preparación de las         Aunque el aislamiento por cultivo, continúa siendo
   muestras, la realización de tinciones y la               una las técnicas más frecuentemente empleadas
   inoculación en los medios de cultivo para su             en el diagnóstico de las enfermedades infecciosas,
   posterior incubación. En este proceso es preciso         existen en la actualidad otras técnicas cuya
   considerar: a) el tipo de muestra enviada, b) el         principal ventaja sobre el cultivo es la rapidez
   diagnóstico clínico del paciente y c) la petición        diagnóstica. Estas técnicas de diagnóstico rápido
   solicitada.                                              se basan en la detección de antígenos y de ácidos
          El tipo de muestra enviada determina si           nucleicos o en la detección de la respuesta
   requiere o no pretratamiento (centrifugación,            inmunológica. Si bien la detección de ácidos
   homogeneización) previo a la inoculación de los          nucleicos no está al alcance de todos los
   medios de cultivo.                                       laboratorios, las técnicas de detección de
          La información clínica del paciente es            antígenos no requieren tecnología ni equipos
   fundamental para la selección de los medios de           especiales y son fáciles de realizar. Las técnicas
   cultivo a inocular y su posterior incubación.            más utilizadas son la inmunofluorescencia directa,
          De modo general, en función del tipo de           la aglutinación con partículas de látex, el
   muestra, el laboratorio utiliza unos medios de           enzimoinmunoensayo y la inmunocromatografía.
   cultivo primarios que permiten el aislamiento de la      Otras técnicas de diagnóstico rápido basadas en la
   mayoría de los agentes etiológicos más frecuentes        detección    de    la    respuesta    inmunológica
   de los distintos procesos infecciosos. Sin embargo,      (anticuerpos principalmente) han demostrado ser
   en ocasiones el síndrome clínico puede estar             muy útiles en el diagnóstico de determinadas
   causado por microorganismos poco frecuentes              enfermedades infecciosas. Las técnicas más
   cuyo aislamiento requiere el uso de medios de            utilizadas son el Rosa de Bengala (para el
   cultivo específicos y/o selectivos no habituales. La     diagnóstico de la brucelosis) y la detección de
   sospecha de la participación de alguno de estos          anticuerpos heterófilos (para el diagnóstico de la
   microorganismos        poco      habituales,     debe    mononucleosis infecciosa), el RPR (para el
   comunicarse al laboratorio. Igualmente, el               diagnóstico de la sífilis), y la detección rápida
   laboratorio debe dar a conocer a los clínicos de su      presuntiva de infección por el VIH. En la actualidad
   institución    qué     microorganismos       investiga   existen múltiples equipos comercializados para la
   rutinariamente y cuáles debe especificar en la           detección de numerosos microorganismos en
   petición (cartera de servicios o catálogo de             determinadas muestras clínicas (ver tabla 2) que
   pruebas).                                                han demostrado utilidad.

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Tabla 2.- Microorganismos con técnica rápida disponible para su detección en muestras clínicas
Microorganismos                   Muestras                        Técnicas disponibles
Bacterias
                                        a
Haemophilus influenzae tipo b     LCR                             Aglutinación
                                                                                          b
Streptococcus pneumoniae          LCR, orina, muestras            Aglutinación (LCR), IC (orina)
                                  respiratorias
Neisseria meningitidis            LCR                             Aglutinación
                                                                        c                        d
Legionella pneumophila            Muestras respiratorias, orina IFD (respiratorias), IC, EIA (orina)
Streptococcus pyogenes            Exudado faríngeo, lesiones      IC
                                  cutáneas, líquidos estériles
Brucella spp.                     Sangre                          Aglutinación
Clostridium difficile             Heces                           Aglutinación, EIA
Hongos
Aspergillus spp.                  Suero                           Inmunodifusión, EIA
Cryptococcus neoformans           Suero                           Inmunodifusión, EIA
Pneumocystis jiroveci             Muestras respiratorias          IFD
Virus
Rotavirus                         Heces                           IC, Aglutinación
Adenovirus                        Heces, muestras                 IC (heces, respiratorias), Aglutinación
                                  respiratorias                   (heces), IFD (respiratorias)
Virus respiratorio sincitial      Muestras respiratorias          IC, IFD
Virus influenza                   Muestras respiratorias          IC, IFD
Virus parainfluenza               Muestras respiratorias          IFD
Virus de la inmunodeficiencia     Sangre                          IC, EIA
humana
Virus herpes simplex              Lesiones cutáneas               IFD
Virus varicella zoster            Lesiones cutáneas/muestras IFD
                                  respiratorias
Citomegalovirus                   Sangre/muestras                 IFD
                                  respiratorias/orina
Virus Epstein Barr                Sangre                          Aglutinación
Parásitos
Cryptosporidium                   Heces                           Tinción de ácido-alcohol resistencia
Plasmodium                        Sangre                          Giemsa, Gota gruesa, IC
Giardia + Cryptosporidium         Heces                           IFD
Entamoeba histolytica             Heces                           EIA
              a                             b                       c                                    d
Abreviaturas: LCR: Líquido cefalorraquídeo; IC: Inmunocromatografía; IFD: Inmunofluorescencia directa; EIA:
Enzimo inmunoensayo

                                                                                                     5
DOCUMENTO TÉCNICO

                                           PNT-RTP-01
      RECOGIDA, TRANSPORTE Y PROCESAMIENTO GENERAL DE LAS
             MUESTRAS EN EL LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA

                      ELABORADO                                            REVISADO Y APROBADO
                                                                                         Jefe de Servicio
Nombre/Firma                   Fecha                      Nombre/Firma                               Fecha

EDICIÓN           FECHA           ALCANCE MODIFICACIONES

01                                Primera edición

COPIA REGISTRADA Nº..........     ASIGNADA A.......................................................................................

Este documento es propiedad del Servicio de Microbiología del Hospital .......………………. ..................
La información en él contenida no podrá reproducirse total ni parcialmente sin autorización escrita del
Responsable de su elaboración. Las copias no registradas no se mantienen actualizadas a sus
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Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                             procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
       Hospital...........................    en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01      Página 2 de 20

1. PROPÓSITO Y ALCANCE                                                      una escasa cantidad de muestra puede ser la
El propósito de este procedimiento es establecer las                        causa de falsos negativos.
directrices para asegurar la calidad de la fase                          6. El material destinado a cultivo no debe estar en
preanalítica en lo que afecta tanto a la recogida                           contacto con sustancias desinfectantes o
como al transporte de las muestras hasta la llegada                         anestésicas, siempre que sea posible.
al    laboratorio   de    microbiología  previo      al                  7. La muestra se debe recoger, siempre que sea
procesamiento. Asimismo, este procedimiento                                 posible, antes de iniciar cualquier terapia
establece las directrices del procesamiento inicial de                      antimicrobiana.
la muestra de una manera general, una vez recibida                       8. Se debe evitar, siempre que sea posible, el
en el laboratorio.                                                          contacto de la muestra con microbiota normal del
                                                                            paciente, con el objeto de asegurar que la muestra
Este procedimiento es aplicable a todos los laboratorios                    refleje lo mejor posible el lugar de la infección.
de hospitales, centros de salud o cualquier laboratorio                  9. El envío al laboratorio de microbiología debe ser lo
que realice determinaciones de microbiología clínica.                       más rápido posible con objeto de asegurar la
                                                                            supervivencia de microorganismos de difícil
2. FUNDAMENTO                                                               crecimiento y de evitar el sobrecrecimiento de la
Todo el trabajo de un laboratorio de microbiología se                       microbiota normal, acortar el tiempo de contacto
convierte en inútil si las muestras clínicas que se                         con anestésicos locales o con otras sustancias
reciben para el diagnóstico no son de calidad, es decir,                    con acción antimicrobiana utilizadas en la recogida
no están correctamente recogidas y transportadas al                         de la muestra.
laboratorio en las condiciones adecuadas para la
determinación que se solicita. El laboratorio de
microbiología debe proporcionar esta información a los
servicios solicitantes para que tanto la recogida como
el transporte y la conservación se hagan de manera
apropiada.

3. DOCUMENTOS DE CONSULTA
- Seguridad en el laboratorio de microbiología clínica
  (Procedimiento 10). Procedimientos en microbiología
  clínica. Recomendaciones de la SEIMC. Coordinadora
  Elena Loza Fernández de Bobadilla. 2000.
- Procedimientos específicos para cada tipo de técnica.

4. MUESTRAS
En la tabla 3 se puede consultar con más detalle la
muestra de elección para cada determinación
microbiológica,       recipientes,        transporte     y
conservación de cada muestra. Como reglas
generales cabe indicar las siguientes:
1. Antes de recoger la muestra, considerar el
   riesgo/beneficio de la recogida de la muestra para
   el paciente.
2. La muestra debe transportarse en envases
   adecuados con cierres a prueba de fugas (ver
   tablas 4 y 5). La recogida de la muestra deberá
   realizarse en condiciones de máxima asepsia,
   evitando     contaminaciones        ambientales     del
   personal y del propio enfermo a la muestra y
   viceversa.
3. La muestra debe etiquetarse con el nombre del
   paciente, el servicio solicitante, el tipo de muestra y
   la fecha de recogida. En determinados casos será
   importante precisar la hora de recogida.
4. Se recomienda que cada muestra se introduzca en
   una bolsa de plástico que a su vez se introducirá
   en otra donde se incluya el volante. Así se evita
   que los posibles derrames de la muestra invaliden
   el volante de petición.
5. Se debe recoger una cantidad de muestra
   adecuada a la petición (ver tabla 6). En ocasiones
Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                                               procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
                         Hospital...........................    en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01      Página 3 de 20

Tabla 3.- Transporte y conservación de muestras para diagnóstico microbiológico
   Muestra                      Determinación                  Envases                                                      TRANSPORTE                    CONSERVACIÓN
                                                                                                                            Tiempo y temperatura          Tiempo y temperatura
   Abscesos/heridas             Bacterias                      Envase para anaerobios (pref.) o jeringa sin aguja (pref.)   ≤2 h, TA                      ≤24 h, TA
   quemaduras/mordeduras                                       Una para Gram, otra para cultivo (Amies/Stuart)
                                Hongos                         Estéril (pref.)/Torunda                                      ≤2 h, TA                      ≤24 h, TA
                                                               Una torunda para tinción, otra para cultivo (Amies/Stuart)
                                Virus                          Torunda seca1                                                Transferir a TV,              +24 h, -60/-80ºC
                                                                                                                            ≤24 h, 2-8°C
   Biopsias                     Bacterias/Hongos               Estéril                                                      ≤15 min, TA                   ≤24 h, TA
                                Virus                          Estéril                                                      Transferir a TV,              +24 h, -60/-80ºC
                                                                                                                            ≤24 h, 2-8°C
   Catéter/material             Bacterias/Hongos               Estéril                                                      ≤15 min, TA                   ≤24 h, 2-8°C
   protésico
   Catéter urinario             No es aceptable
   Catéter drenaje              No se recomienda               Enviar líquido drenaje/abscesos/aspirados
   Genital                      Bacterias/Hongos               Estéril                                                      ≤2 h, TA                      ≤24 h, TA
   (Secreción prostática)
   Genital (cervical/           Chlamydia trachomatis          Medio transporte clamidia (cultivo)                          Inoculación inmediata
   uretral/rectal                                              Torunda seca (fluorescencia)
   Genital (cervical/rectal/    Bacterias (gonococo)           Inoculación directa sobre medios de cultivo
   uretral)                                                    Torunda con medio transporte                                 ≤2 h, TA                      ≤24 h, TA
   Genital (líq. amniótico)     Bacterias/Hongos               Transporte de anaerobios                                     ≤15 min, TA                   ≤24 h, TA
   Genital (úlcera)             Virus                          Torunda seca1                                                Transferir a TV,              +24 h, -60/-80ºC
   (cualquier localización)                                                                                                 ≤24 h, 2-8°C
   Genital (semen)              No se recomienda
   Genital (úlcera)             Treponema pallidum             Campo oscuro                                                 Inmediata visualización
   (cualquier localización)
   Genital (Uretral)            Mycoplasma hominis             Torunda de dacrón                                            Inocular a medio transporte   ≤8 h, TA
                                Ureaplasma urealyticum                                                                      de mycoplasmas                ≤36 h, 2-8°C
   Genital (vaginal)            Bacterias/Hongos               Torunda con medio transporte (cultivo)                       ≤2 h, TA                      ≤24 h, TA
                                                               Torunda seca para Gram
   Heces                        Bacterias                      Estéril con Cary Blair                                       ≤2 h, TA                      ≤24 h, 2-8°C
Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                                             procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
                       Hospital...........................    en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01      Página 4 de 20

Muestra                       Determinación                  Envases                                         TRANSPORTE                     CONSERVACIÓN
                                                                                                             Tiempo y temperatura           Tiempo y temperatura
                              Clostridium difficile          Estéril                                         ≤1 h, TA                       48 h, 2-8°C para cultivo
                                                                                                             1-24 h, 2-8°C                  72 h, 2-8°C (citotoxina)
                                                                                                             >24 h, -20°C                   +72 h, -60/-80°C (citotoxina)
                              Parásitos                      Transporte con SAF, FOR + PVA, MIF + PVA        Indefinido, TA                 Indefinido, TA
                              Rotavirus                      Estéril                                         2-8°C
Heces/Rectal                  Virus                          Torunda seca1                                   Transferir a TV,               +24 h, ºC
                                                                                                             ≤24 h, 2-8°C
Jugo gástrico                 Bacterias/Hongos               Estéril                                         ≤2 h, 2-8°C                    ≤24 h, 2-8°C
                              Micobacterias                  Estéril                                         ≤15 min, TA o neutralizar      ≤24 h, 2-8°C
                                                                                                             en la 1ª hora de la recogida
Lesiones fúngicas             Hongos                         Inoculación directa sobre medios de cultivo     ≤24 h, TA
(piel, pelo, uñas)
Líquidos                      Bacterias                      Estéril/botellas de hemocultivos                ≤15 min, TA                    ≤24 h, TA
  estériles                                                  transporte para anaerobios
                              Hongos                         Estéril                                         ≤15 min, TA                    ≤24 h, 2-8°C
                              Virus                          Estéril                                         ≤15 min, 2-8°C                 ≤72 h, 2-8°C
                              Serología                      Estéril                                         ≤15 min, TA                    ≤24 h, 2-8°C
                              Parásitos                      Estéril                                         ≤15 min, TA                    ≤24 h, TA
Médula ósea                   Bacterias/Hongos               Estéril/botellas de hemocultivos                ≤24 h, TA                      ≤24 h, TA
                              Parásitos (Leishmania)         Estéril                                         ≤2 h, TA                       ≤2 h, TA
                              Virus                          Estéril                                         Transferir a TV,               +24 h, -60/-80ºC
                                                                                                             ≤24 h, 2-8°C
Ocular (Conjuntival)          Bacterias/Hongos               Torunda con medio de transporte                 ≤2 h, TA                       ≤24 h, TA
Ocular (Raspado corneal) Bacterias/Hongos                    Inoculación directa en medios de cultivo        ≤15 min, TA                    ≤24 h, TA
Ocular                        Virus                          Torunda seca1                                   Transferir a TV,               +24 h, -60/-80ºC
                                                                                                             ≤24 h, 2-8°C
Oído externo                  Bacterias/Hongos               Torunda con medio de transporte                 ≤2 h, TA                       ≤24 h, 2-8°C
Oído interno                  Bacterias/Hongos               Torunda con medio de transporte                 ≤2 h, TA                       ≤24 h, TA
                                                             Transporte para anaerobios
                                                             Tubo estéril
Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                                                procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
                          Hospital...........................    en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01      Página 5 de 20

Tabla 3.- Continuación
      Muestra                    Determinación                  Envases                                              TRANSPORTE                       CONSERVACIÓN
                                                                                                                     Tiempo y temperatura             Tiempo y temperatura
      Orina                      Bacterias/Hongos               Estéril                                              ≤2 h, TA (sin conservante)       ≤24 h, 2-8°C
                                                                Tubos con conservante (ác. bórico-formiato sódico)   ≤24 h, 2-8°C (con conservante)
                                 Virus                          Estéril                                              ≤24 h, 2-8°C
                                 M. hominis/                    Estéril                                              Inocular en medio transporte     ≤8 h, TA
                                 U. urealyticum                                                                      de micoplasma                    ≤36 h, 2-8°C
                                 Leptospira                     Estéril                                              ≤1 h, TA
                                 Parásitos                      Estéril                                              ≤2 h, TA                         ≤24 h, 2-8°C
                                 Antígeno Legionella            Estéril                                              ≤2 h, TA                         ≤24 h, TA
                                                                                                                                                      ≤24, 2-8°C
                                                                                                                                                      +14 d, -20°C
                                 Antígeno de neumococo          Estéril                                              ≤2 h, TA                         ≤24 h, TA
                                                                                                                                                      ≤24, 2-8°C
                                                                                                                                                      +14 d, -20°C
      Orina suprapúbica          Bacterias                      Transporte para anaerobios                           ≤2 h, TA                         ≤24 h, 2-8°C
      Rectal                     Bacterias                      Torunda con medio de transporte                      ≤2 h, TA                         ≤24 h, TA
      Sangre                     Hemocultivo                    Botellas de hemocultivos                             ≤2 h, TA                         ≤24 h, TA
                                 Serología                      Suero                                                ≤24 h, 2-8°C                     +24h, -20°C
                                                                Plasma (no válido si hay que inactivar)                                               +24h, -60/-80°C
                                                                                                                                                      (evitar
                                                                                                                                                      descongelación)
                                 Virus                          Plasma                                               ≤2 h, TA
                                                                (con EDTA para técnicas moleculares)
                                 Carga vírica VIH               Plasma (nunca heparina)                              ≤2 h, TA                         ≤72 h, -20-°C
                                                                                                                                                      +72h, -60/-80°C
                                 Cultivo Leishmania             Sangre no coagulada (con heparina pref.)             ≤15 min, TA
                                 Parásitos                      Sangre no coagulada (con EDTA)                       ≤15 min, TA
Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                                                         procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
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Tabla 3.- Continuación
          Muestra                         Determinación                   Envases                                                             TRANSPORTE                             CONSERVACIÓN
                                                                                                                                              Tiempo y temperatura                   Tiempo y temperatura
          Tracto respiratorio             Bacterias                       Transporte para anaerobios/Estéril                                  ≤15 min, TA                            ≤24 h, TA
          superior (sinusal)              Hongos                          Estéril
          Tracto respiratorio             Bacterias/Hongos                Torunda con medio de transporte                                     ≤2 h, TA                               ≤24 h, TA
          superior (faríngeo)
          Tracto respiratorio             Antígeno S. pyogenes            Torunda seca (Dacrón/algodón)                                       ≤2 h, TA                               ≤72 h, 2-8°C
          superior (faríngeo)
                                          Virus                           Torunda seca1                                                       Transferir a TV,                       +24 h, -60/-80ºC
                                                                                                                                              ≤24 h, 2-8°C
          Tracto respiratorio             Bacterias/Hongos                Torunda con medio de transporte                                     ≤2 h, TA                               ≤24 h, TA
          superior (nasal)
                                          Bacterias/Hongos                Torunda con medio de transporte                                     ≤2 h, TA                               ≤24 h, TA
                                          Virus                           Torunda seca1                                                       Transferir a TV,                       +24 h, -60/-80ºC
                                                                                                                                              ≤24 h, 2-8°C
          Tracto respiratorio             Bordetella pertussis            Torunda seca de alginato                                            Inmediato/2-8°C
          superior (nasofaríngeo)
          Tracto respiratorio             Bacterias/Hongos                Estéril                                                             ≤2 h, TA                               ≤24 h, 2-8°C
          Inferior2/esputo
                                          Virus                           Estéril                                                             Transferir a TV,                       +24 h, -60/-80ºC
                                                                                                                                              ≤24 h, 2-8°C
1
 Para virus: Se aceptan torundas de algodón, dacrón o rayón con bastón de aluminio o plástico. No aceptar torundas de alginato o con bastón de madera. 2Muestras del tracto respiratorio inferior: aspirado bronquial,
lavado broncoalveolar, cepillado por telescopado, aspirado traqueal, punción transtorácica aspirativa con aguja ultrafina.
Abreviaturas: TA: temperatura ambiente, TV: medio de transporte de virus; SAF: acetato sódico-formalina, FOR: 10% formalina, MIF: mertiolato-ioduro-formalina; pref.: preferentemente.
Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                            procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
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Tabla 4.- Sistemas de transporte para la investigación de microorganismos aerobios

Sistema de transporte                                 Comentarios
Torundas con medio de transporte                      Torundas en tubos de plástico con medio de transporte
                                                      que mantiene un pH favorable y previene la desecación de
                                                      la muestra.

Torundas de alginato cálcico                          Útiles para la investigación de Chlamydia spp. y
                                                      Bortedetella spp. Pueden ser tóxicas para N.gonorrhoeae,
                                                      U. urealyticum y virus útiles para la toma de muestra de
                                                      conexiones de catéteres intravasculares.
Torundas de dacrón                                    Útiles para la investigación de virus
Torundas de algodón                                   Pueden inhibir a Chlamydia spp. Cuando la torunda es de
                                                      madera, puede inactivar a virus del grupo Herpes e
                                                      interferir con las pruebas de identificación de Ureaplasma.

Torundas para exudados nasofaríngeos                  Torundas flexibles que emplean alambre en lugar de
                                                      varilla de madera
Tubos estériles de boca ancha                         Útiles para el transporte de orinas, esputos,
                                                      broncoaspirados, lavados broncoalveolares, heces,
                                                      biopsias.

Tubos estériles                                       Líquidos estériles, catéter telescopado, aspirados de
                                                      abscesos y heridas
Tubos estériles con medio de transporte o Tubo estéril con medio de transporte (Cary Blair) para
conservante                               enteropatógenos en heces.
                                          Tubo con fijador (alcohol polivinílico) para parásitos en
                                          heces.
                                          Tubo con conservante (ácido bórico–formiato de sodio)
                                          para orinas. Mantiene la población bacteriana durante 48h
                                          a temperatura ambiente sin necesidad de refrigeración.
Placas de Petri estériles                             Útiles para pelos, escamas cutáneas y uñas

Tabla 5.- Sistemas de transporte para la investigación de microorganismos anaerobios

Sistema de transporte                                 Comentarios
Torundas con sistemas de transporte
específicos para anaerobios
Viales y tubos con atmósfera anaerobia                Contienen un medio de transporte semisólido con un
                                                      agente reductor y un indicador. Cualquier coloración azul
                                                      de dicho medio indica exposición al aire.

Bolsas de anaerobiosis                                La muestra se introduce en el interior de una bolsa
                                                      impermeable en cuyo interior se introduce un catalizador y
                                                      un generador de hidrógeno y CO2.

Jeringa para la obtención de aspirados                Cuando no se dispone de ninguno de los sistemas
                                                      anteriores o bien la cantidad de muestra es mínima, puede
                                                      utilizarse la misma jeringa con la que se ha obtenido. Para
                                                      ello hay que eliminar el aire y taponar la aguja con un
                                                      tapón de goma.
Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                              procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
        Hospital...........................    en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01      Página 8 de 20

Tabla 6.- Consideraciones sobre la toma de las muestras

1. Consideraciones sobre la toma de las muestras del sistema nervioso central

                                 Volumen mínimo
Cultivo                                                      Comentarios
                                 recomendado (ml)
Bacterias                        1                           Enviar el tubo mas turbio
Hongos                           2                           Descartar Cryptococcus spp.
Micobacterias                    2
Anaerobios                       2                           Abscesos y biopsias
Parásitos                        2                           Abscesos o biopsias. Naegleria spp. y
                                                             Acantamoeba spp. también en LCR.
Virus                            1-2

2.- Consideraciones sobre los líquidos estériles

Cultivo                                       Volumen (ml)      Comentarios
Bacterias                                     1-5               Especificar sospecha de artritis gonocócica
Hongos                                        > 10
Micobacterias                                 > 10
Anaerobios                                    1-5               Usar un medio de transporte con anaerobiosis

3.- Consideraciones sobre las muestras del tracto respiratorio

Cultivo                             Volumen (ml)         Comentarios
Bacterias                           No aplicable         Especificar sospecha de Legionella
Hongos                              3-5                  Esputos, broncoscopias, aspirados y biopsias
                                                         pulmonares
Pneumocystis jiroveci               2                    Esputo inducido, lavado broncoalveolar o biopsia
                                                         pulmonar
Micobacterias                       5-10                 Esputo, broncoscopia, aspirados y biopsias pulmonares
Anaerobios                          1                    Aspirado sinusal, timpanocentesis, aspirados y biopsias
                                                         pulmonares
Parásitos                           3-5                  Amebas, huevos de helmintos, larvas de Echinococcus,
                                                         Ascaris y Strongyloides spp.

4. Consideraciones sobre las muestras oculares

Cultivo                    Comentarios
Bacterias                  Inocular los medios directamente
Hongos                     Inocular los medios directamente
Micobacterias              No usar torundas
Anaerobios                 Líquido intraocular
Parásitos                  Descartar Acantamoeba spp.
Chlamydia                  No usar torundas de algodón
Virus                      No usar torundas de alginato cálcico
Servicio de Microbiología                     Recogida, transporte y          Fecha:
                                               procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
        Hospital...........................     en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01      Página 9 de 20

Tabla 6.- Continuación

5. Consideraciones sobre las muestras gastrointestinales

Cultivo                                 Comentarios
Bacterias                               Heces
                                        Biopsia gástrica: Helicobacter pylori
                                        Torunda rectal: Patógenos entéricos (especialmente Shigella spp.) y
                                        Neisseria gonorrhoeae.
Hongos                                  Jugo gástrico, biopsia gástrica, biopsia esofágica
Micobacterias                           Jugo gástrico, biopsia gástrica, heces
Parásitos                               Jugo duodenal (Giardia spp y Strongyloides stercoralis)
                                        Biopsia rectal: Entamoeba histolytica
                                        Biopsias intestino delgado: Giardia spp. Cryptosporidium y
                                        Microsporidium spp.
Virus                                   Biopsia esofágica (CMV y Herpes) y biopsia rectal (Herpes).

6.- Consideraciones sobre las muestras de orina

Cultivo                                       Volumen (ml)      Comentarios
Bacterias                                     0,5-1             No válidas orinas de 24 horas
Hongos                                        > 20              No válidas orinas de 24 horas
Micobacterias                                 > 20              No válidas orinas de 24 horas
Anaerobios                                    1                 Sólo en orinas suprapúbicas
Parásitos                                     Orina de 24       Schistosoma haematobium, Trichomonas
                                              horas             vaginalis, Onchocerca volvulus
Virus                                         10-50             No válidas orinas de 24 horas. Adenovirus y CMV

7.- Consideraciones sobre las muestras del tracto genital y enfermedades de transmisión sexual.

Cultivo                                       Muestra recomendada
Neisseria gonorrhoeae                         Cervical, uretral, anal
Bacterias                                     Cervical, vaginal, secreción prostática
Trichomonas vaginalis                         Vaginal, secreción prostática
Hongos                                        Anal, vaginal, cervical
Anaerobios                                    Abscesos
Virus Herpes                                  Úlceras genitales
Chlamydia trachomatis                         Uretral, vulva, cervical
Treponema pallidum                            Úlceras genitales
Ureaplasma urealyticum                        Uretra, secreción prostática
Linfogranuloma venéreo                        Rectal, cervical, uretral, úlceras genitales
Haemophilus ducreyi                           Úlceras y nódulos genitales

8.- Consideraciones sobre las muestras de piel y tejidos blandos

Cultivo                Comentarios
Bacterias              Usar aspirados con jeringas o biopsias de tejido preferiblemente
Hongos                 Dermatofitos, levaduras, filamentosos y hongos dimórficos
Micobacterias          Mycobacterium marinum, Mycobacterium fortuitum y Mycobacterium chelonae
Anaerobios             Poco comunes en infecciones superficiales, investigar sobre todo en mordeduras y
                       traumas
Virus                  Virus herpes simplex y varicella zoster
Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                            procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
      Hospital...........................    en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01      Página 10 de 20

4.1. CRITERIOS DE ACEPTACIÓN Y RECHAZO DE                                 muestras en formol), no se aceptarán estas muestras
LAS MUESTRAS/TOMA DE DECISIONES                                           y se informará al servicio solicitante de la inadecuación
El laboratorio de microbiología debe determinar, una vez                  de la muestra.
recibida la muestra en el laboratorio, si ésta cumple con
los requisitos para ser procesada. Estos requisitos                     4.2. MANTENIMIENTO DE MUESTRAS TRAS EL
incluyen entre otros, una correcta identificación, tipo de              PROCESAMIENTO
muestra adecuada para la petición, y condiciones                        Es recomendable mantener las muestras conservadas
adecuadas de transporte y conservación. Es necesario                    (dependiendo de la muestra/petición: a temperatura
que cada laboratorio establezca y difunda a los servicios               ambiente, en estufa de 35-37°C, en nevera de 2-8°C, o
peticionarios sus propios requisitos de la aceptación de                congeladas a -20°C ó a –70°C) un tiempo tras su
una muestra para estudio microbiológico.                                procesamiento. El tiempo de conservación debe ser
                                                                        aquel que garantice que un problema en el
El laboratorio de microbiología debe disponer también                   procesamiento o en la interpretación de los cultivos
de un sistema de registro de estas incidencias en el que                pueda ser solucionado recuperando la muestra para un
figure la muestra implicada, la persona que realiza la                  nuevo procesamiento. El tiempo mínimo oscila entre 1-3
recepción de la muestra, el tipo de incidencia, la persona              días. Se recomienda guardar tanto las muestras
con la que se contacta del servicio solicitante y la                    procesadas como las rechazadas (no procesadas).
resolución de la incidencia (si la muestra no se procesa,
si finalmente se decide su procesamiento y en qué                       4.3.    TRANSPORTE          DE    MUESTRAS         POR
condiciones, etc.). Como sugerencia se podía utilizar el                SUPERFICIE Y POR VÍA AÉREA
formato del Anexo 1, Registro de incidencias en la                       Cada vez es más frecuente la realización de
recepción de las muestras.                                              procedimientos microbiológicos en lugares distantes
                                                                        al de la toma de muestra. Aunque es obvio que las
Las incidencias más frecuentes en la llegada de una                     muestras biológicas, sean infecciosas o no, deben
muestra al laboratorio de microbiología y las acciones a                estar correctamente empaquetadas y etiquetadas
realizar (toma de decisiones) ante cada caso son las                    para su transporte y envío, se ha hecho necesario el
siguientes:                                                             desarrollo de legislaciones o guías específicas, tanto
- Muestra deficientemente identificada: no se                           a nivel nacional como internacional, debido al
  aceptará una muestra sin identificar, mal                             aumento del transporte de muestras fuera de los
  identificada o en la que no coincidan la                              recintos hospitalarios y entre los distintos centros
  identificación del volante de petición con la de la                   sanitarios. El objetivo de este desarrollo es el reducir
  muestra. En cualquier caso se contactará con el                       al mínimo posible el riesgo de accidentes.
  servicio peticionario haciéndole conocer la                           4.3.1.- Transporte internacional aéreo. Las
  necesidad de que procedan a la correcta                               regulaciones internacionales para el transporte de
  identificación de la muestra. Si se puede recoger                     material infeccioso están basadas en las
  otra     muestra,    se    solicitará  nuevamente.                    Recomendaciones del Comité de Expertos de las
  Dependiendo de la importancia de la muestra, se                       Naciones Unidas para el Transporte de Artículos
  puede optar a su procesamiento antes de la                            Peligrosos. Estas recomendaciones están incluidas
  correcta identificación con el objeto de que no se                    en las regulaciones de la Unión Postal Universal
  deteriore la misma.                                                   (UPU), La Organización Internacional de Aviación
- Muestras derramadas: no se aceptarán muestras                         (OIAC) y la Asociación Internacional de Transporte
  claramente derramadas y se solicitará una nueva                       Aéreo (IATA), todas ellas asesoradas por la OMS.
  muestra. Se procederá como en el caso anterior
  solicitando una nueva muestra. En el caso de no ser                   Actualmente, las muestras se clasifican en
  posible la recogida de una nueva muestra, desinfectar                 sustancias infecciosas (clasificadas dentro de uno
  externamente el envase o trasvasar la muestra a un                    de los cuatro grupos de riesgo definidos por la OMS)
  contenedor estéril. En este caso, se indicará en el                   y en muestras para diagnóstico.
  informe que la muestra estaba derramada y que los
  resultados deben ser interpretados con la debida                      La modificación en enero de 2003 de la clasificación
  precaución.                                                           de una muestra como muestra para diagnóstico
- Transporte/conservación inadecuados: si no se                         permite que las que cumplan este criterio puedan ser
  cumplen los requisitos de la tabla 3, se solicitará                   clasificadas como ONU 3373 y embaladas según las
  nueva muestra. En el caso de muestras que no se                       instrucciones de embalaje 650 del manual de la
  puedan volver a recoger (por ejemplo: muestras                        IATA, con las siguientes excepciones:
  quirúrgicas) se puede optar por procesarlas                           - patógenos del grupo 4 de riesgo.
  informando por escrito al servicio solicitante de la                  - Agentes identificados y patógenos nuevos o
  incidencia en la recogida/transporte de la muestra y                       emergentes.
  alertando de que los resultados obtenidos deben ser                   - Cultivos o “stocks” en grandes concentraciones.
  interpretados con la precaución correspondiente. En el                En los tres casos anteriores los envíos deberán
  caso de que el transporte deficiente invalide                         seguir siendo clasificados bajo ONU 2814 ó 2900 y
  totalmente el estudio microbiológico (por ejemplo,
Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                            procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
      Hospital...........................    en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01      Página 11 de 20

embalados de acuerdo con la instrucción del                             6. Normas para envío con refrigerantes (dióxido de
embalaje 602 de IATA.                                                      carbono y nitrógeno líquido).
                                                                        7. Ejemplos de formato de los documentos de envío
Sistema básico de embalaje (ver figura 1). Se                              (los originales pueden obtenerse de la compañía
compone de:                                                                transportadora).
                                                                        4.3.2.- Transporte nacional y local por superficie.
Recipiente primario estanco, a prueba de                                Otras posibilidades de transporte de material
filtraciones, etiquetado, que contiene la muestra. El                   biológico incluyen el traslado de muestras dentro de
recipiente debe envolverse en material absorbente.                      un hospital o centro, de un centro de salud a un
                                                                        hospital, de un laboratorio a otro, de un hospital a
Recipiente secundario estanco, a prueba de                              otro dentro de la misma ciudad o a otra ciudad. Estos
filtraciones, que encierra y protege el recipiente                      servicios de entrega deben ser gestionados por el
primario. Se pueden colocar varios recipientes                          propio hospital, por el servicio de salud o por
primarios envueltos en un recipiente secundario. Se                     cualquier organización de transportes o agencia que
debe usar suficiente material absorbente para                           haya sido autorizada.
proteger a todos los recipientes primarios y evitar
choques entre ellos.                                                    Los principios en los que se basa un transporte
                                                                        seguro son los mismos que se aplican para el
Recipiente externo de envío. El recipiente                              transporte internacional y la finalidad es que la
secundario se coloca en un paquete de envío que                         muestra no tenga ninguna posibilidad de salir del
protege al recipiente secundario y su contenido de                      embalaje en las circunstancias normales de
los elementos externos, tales como daño físico y                        transporte.
agua, mientras se encuentra en tránsito.
                                                                        Para el embalaje y transporte de material biológico
Los formularios con datos, cartas y otras                               en estas situaciones (transporte local por superficie)
informaciones de identificación de la muestra deben                     se recomienda un embalaje tipo, como el envase
colocarse pegados con cinta adhesiva en el exterior                     homologado de la figura 1 y se deben tener en
del recipiente secundario.                                              cuenta las siguientes indicaciones:

Para el transporte de sustancias infecciosas se debe                    1. Los recipientes de las muestras deben ser
utilizar el sistema de embalaje básico con                                 herméticos y a prueba de fugas de líquidos.
requerimientos específicos de etiquetado y                              2. Si el recipiente es un tubo, debe estar cerrado
documentación.                                                             herméticamente, con tapa de rosca y colocado en
                                                                           una gradilla, de tal forma que mantenga su
En los vuelos internacionales está estrictamente                           posición vertical.
prohibido que los pasajeros transporten sustancias                      3. Los recipientes con muestras y gradillas deben
infecciosas con ellos o en su equipaje de mano.                            colocarse en una caja resistente de metal o
Igualmente está prohibida la utilización del correo                        plástico y a prueba de fugas de líquido, que
diplomático para el transporte de este tipo de                             contenga una cubierta segura y que cierre
material.                                                                  perfectamente.
                                                                        4. La caja donde se transportan los materiales deberá
La Guía para el transporte de sustancias infecciosas                       ser asegurada firmemente en el vehículo de
y especímenes diagnósticos, publicada por la OMS                           transporte.
en 1997, permite un conocimiento detallado de los                       5. Cada caja de transporte deberá estar etiquetada
requerimientos específicos para las diferentes                             de forma adecuada y de acuerdo a su contenido.
situaciones que se pueden plantear ante el envío de                     6. Los formularios con los datos de identificación de
material biológico, algunos de los cuales se plantean                      los especímenes deben acompañar a cada caja de
a continuación:                                                            transporte.
                                                                        7. El vehículo de transporte deberá ir provisto de
1. Cantidad de sustancias infecciosas que pueden                           material absorbente, desinfectantes, un contenedor
   enviarse en un paquete.                                                 para desechos a prueba de fugas líquidas y
2. Tipos de etiquetas de riesgo para sustancias                            guantes resistentes de uso múltiple.
   infecciosas y para microorganismos genéticamente                     El transporte de material biológico requiere una
   modificados.                                                         buena colaboración entre el remitente, la compañía
3. Tipos de etiquetas de riesgo para microorganismos                    de transporte y el destinatario, y cada uno debe
   no infecciosos.                                                      asumir sus responsabilidades para garantizar que el
4. Etiquetas para envío con dióxido de carbono (hielo                   producto llega a su destino oportunamente y en
   seco).                                                               buenas condiciones.
5. Información que debe figurar en la etiqueta.
Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                             procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
       Hospital...........................    en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01      Página 12 de 20

           Figura 1.- Sistema básico de embalaje

5. MEDIOS DE CULTIVO, REACTIVOS Y                                        rango de aceptación, anotar la incidencia y realizar las
PRODUCTOS                                                                acciones frente a esa variación. Estas acciones, por un
Los medios de cultivo y reactivos recomendados para                      lado, deben asegurar los resultados derivados de los
el procesamiento de muestras se detallan en la tabla                     cultivos y por otro corregir esa desviación.
7. Las condiciones de almacenamiento (temperatura,
humedad, etc.) de los reactivos y medios de cultivo                      De una manera genérica se sugieren los siguientes
utilizados deben ser establecidas, controladas y                         intervalos de aceptación:
revisadas (ver más detalles en el apartado 6).                           • estufas de 35-37°C se acepta una mínima superior o
                                                                            igual a 34°C y máxima inferior o igual a 37,5°C
Se deben realizar, con periodicidad (semanal, mensual,                   • estufas de 42°C se aceptan variaciones entre 40-43°C
trimestral, etc.) establecida por el propio laboratorio, una             • estufas de 30°C se aceptan variaciones entre 28-32ºC
revisión de los materiales almacenados (cantidad,                        Para las neveras el intervalo de tolerancia que se acepta
caducidades, estado general) con el fin de comprobar el                  es generalmente de 2º-8°C, aunque puede variar en
estado de los mismos, verificando su correcta ubicación                  función de los reactivos que contengan.
en los espacios identificados y definidos para ellos en el
almacén y su aptitud para el uso (ver como ejemplo de                    Todos los termómetros utilizados en la medida de
formato el del Anexo 2, Revisión de almacén).                            temperaturas de los aparatos se han de verificar
                                                                         mediante un termómetro de referencia calibrado. Se
6. APARATOS Y MATERIAL                                                   introducirá el termómetro utilizado para la medición de la
Los equipos habituales necesarios en el procesamiento                    temperatura y el termómetro calibrado en el equipo
de una muestra para estudio microbiológico son:                          correspondiente (nevera, congelador o estufa) durante
  - Estufas          - Congeladores                                      un mínimo de 15 minutos. Se aceptarán aquellos
  - Neveras           - Centrífugas                                      termómetros cuyos desvíos no sobrepasen los límites
                                                                         establecidos para cada uso concreto. La periodicidad de
De manera periódica (preferiblemente a diario) debe                      la verificación de los termómetros con el termómetro
controlarse la temperatura (y humedad/presión de CO2                     calibrado debe ser establecida por el propio laboratorio.
si fuera necesario) de cada estufa/nevera/congelador al
inicio de la jornada de trabajo con un termómetro                        Existen sistemas automáticos para el control de la
situado permanentemente en el centro de cada equipo.                     temperatura, humedad, presión de CO2, etc., que
El termómetro debe permitir la medida de la temperatura                  controlan de una manera permanente (en intervalos de
máxima y mínima alcanzadas. Se anotará en la hoja de                     15-20 minutos) los anteriores parámetros con gran
registro de temperatura de cada aparato (como ejemplo                    fiabilidad y que utilizan sondas de referencia verificadas
se propone la del Anexo 3, Registro de temperatura) y                    por organismos certificados. Estos sistemas alertan de
en el caso de temperaturas mínima o máxima fuera del                     los desvíos que se producen de una manera más rápida
Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                      procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
Hospital...........................    en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01      Página 13 de 20

    Tabla 7.- Recomendaciones de medios de cultivo y tinción de Gram para muestras
    microbiológicas seleccionadas

    Muestras/Microorganismo                       Gram AS        ACH      MCK      Tio/BHI Otros
                                                                                                                     1
    Biopsias                                        X      X       X         X         X       Medios anaerobios
    Biopsias (intestinal, colon, rectal)                                                       C.difficile
                                                                                               Enteropatógenos
    Biopsias gástricas                              X                                          Helicobacter pylori
    Catéter vascular                                       X
    Conexiones/Piel pericatéter                            X
    Genitales
             Rectal                                        X                                   S. agalactiae
             Uretral                                X              X                           Thayer Martin
             Cervical                                      X       X                           Thayer Martin
             Secreción prostática                          X       X         X         X
             Vaginal                                       X                                   S. agalactiae
    Heces                                                                                      Caldo Selenito, SS o similar
                                                                                               Campylobacter selectivo
                                                                                               Sangre ampicilina
                                                                                                                 1
    Heridas profundas, mordeduras,                  X      X       X         X         X       Medios anaerobios
    quemaduras, úlceras, abscesos
    Heridas superficiales                           X      X       X         X         X
                                                                                                                     1
    Jugo gástrico                                          X       X         X         X       Medios anaerobios
    Líquidos estériles
                                                                                                                     1
             L. ascítico, peritoneal,               X      X       X         X         X       Medios anaerobios
             pericárdico, sinovial
             L. pleural                             X      X       X         X         X       BCYE
                                                                                                                 1
                                                                                               Medios anaerobios
                 Líquido cefalorraquídeo            X      X       X                   X
    Ocular
              Exudado conjuntival                          X       X
                                                                                                                     1
              L. intraocular                        X      X       X         X         X       Medios anaerobios
    Oído externo                                           X       X         X
    Timpanocentesis                                 X      X       X         X         X
    Orina (micción, sondaje)                               X                 X                 Agar Cled
                                                                                                                 1
    Orina suprapúbica                               X      X       X         X                 Medios anaerobios
    Tracto respiratorio inferior
              Broncoaspirado                        X      X       X         X                 BCYE
              Cepillado bronquial con               X      X       X         X                 BCYE
                                                                                                                 1
              telescopado                                                                      Medios anaerobios
              Lavado broncoalveolar                 X      X       X         X                 BCYE
              Esputo                                X      X       X         X
    Tracto respiratorio superior
                                                                                                                     1
              Aspirado sinusal                      X      X       X         X         X       Medios anaerobios
              Faríngeo                                     X                                   Alternativa CNA
              Nasal                                        X                                   Agar Manitol sal
    Clostridium difficile                                                                      CCFA
    E.coli O157H7                                                                              Sorbitol-MCK
    Bordetella pertussis                                                                       Bordet Gengou
                                                                                               IFD si no cultivo
    Helicobacter pylori                                    X                                   Agar Helicobacter
                                                                                               Thayer Martin
                                                                                               Agar Brucella
    Legionella                                                                                 BYCE
    Neisseria gonorrhoeae                                          X                           Thayer Martin
    Streptococcus agalactiae                               X                                   Todd-Hewitt
                                                                                               Agar Granada
    Vibrio                                                                                     TCBS
    Yersinia                                                                                   CIN
    1:
       medios anaerobios: agar sangre para anaerobios (Brucella agar), agar feniletanol para anaerobios.
    agar sangre lacada-vancomicina-kanamicina (ASKVL), agar Bacteroides bilis esculina (BBE)
    Abreviaturas: AS: Agar sangre; ACH: Agar chocolate; MCK: Agar MacConkey; Tio/BHI: Caldo tioglicolato ó infusión
    cerebro-corazón de buey; BCYE: agar enriquecido para cultivo de Legionella; CNA: agar sangre colistina-ácido nalidíxico;
    CCFA: agar cicloserina-cefoxitina-fructosa-yema de huevo; TCBS: agar tiosulfato-citrato-sales biliares-sacarosa; CIN:
    agar cefsulodina-irgasán-novobiocina
Servicio de Microbiología                    Recogida, transporte y          Fecha:
                                            procesamiento general de muestras                 PNT-RPT-01
      Hospital...........................    en el laboratorio de microbiología Edición Nº 01      Página 14 de 20

que el control manual, controlan todos los equipos del                       - Traspasar la muestra al interior de un mortero
laboratorio y generan los informes de estos                                    estéril y añadir 1-2 ml de caldo de cultivo
parámetros.                                                                  - Con ayuda de la mano del mortero triturar la
7. PROCESAMIENTO                                                               muestra mediante movimientos rotatorios
7.1. RECEPCIÓN DE LA MUESTRA                                                 - Traspasar la muestra utilizando una pipeta
  Cada laboratorio de microbiología debe disponer                              Pasteur estéril a un contendor estéril
de unas normas de recepción y aceptación de                                  7.2.1.2.3. Mediante Stomacher
muestras para diagnóstico microbiológico. En el acto                         - Colocar la muestra en el interior de una bolsa
de la aceptación de muestras por el laboratorio se                             de Stomacher y añadir 1-2 ml de caldo de
deben comprobar los siguientes aspectos:                                       cultivo
  - La trazabilidad, es decir, la correspondencia de la                      - Colocar la bolsa en el interior del Stomacher,
     muestra con el volante de petición (con el                                dejando unos centímetros de la bolsa
     paciente). En la petición se debe incluir:                                sobresalir sobre la tapa del Stomacher.
     - Nombre completo del paciente, número de                               - Cerrar la tapa y conectar el Stomacher durante
       historia o de la seguridad social o DNI                                 1 a 5 minutos.
     - Servicio solicitante, nombre del médico                               - Desconectar el Stomacher, extraer la bolsa y
       solicitante                                                             traspasar su contenido a un contenedor estéril.
     - Tipo de muestra (descripción completa y                          Las muestras que se procesen para hongos no se
       método de obtención)                                             homogenizan sino que se deben cortar en pequeños
     - Hora y/o fecha de recogida                                       trozos con la ayuda del bisturí y se inoculan
     - Enfermedad de base y motivo de la petición                       directamente sobre los medios de hongos con objeto
  - El correcto transporte de la muestra para la                        de evitar que determinados hongos no septados
     petición solicitada                                                sean inviables.
  - La petición correcta de determinaciones                             7.2.2.- Preparación de extensiones
     microbiológicas                                                       7.2.2.1. Mediante impronta: Piezas de tejido
                                                                           - Colocar el tejido en una placa de Petri y cortar
7.2. PROCESAMIENTO DE LA MUESTRA                                             una porción con la ayuda de una hoja de bisturí
   El laboratorio someterá a la muestra a un                               - Con unas pinzas, tomar la pieza cortada y
procesamiento en función de sus protocolos de                                realizar impresiones por la superficie del corte
trabajo y de la información que aporta el servicio                           sobre un portaobjetos
solicitante sobre la muestra y el paciente. Así el                           7.2.2.2. Extensiones finas: material muy
procesamiento dependerá de varios factores:                                  purulento
   • Petición del servicio solicitante                                         - Tomar una porción de la muestra y colocarla
   • Tipo de muestra/técnica de obtención                                         sobre un portaobjetos
   • Diagnóstico del paciente/enfermedad de base                               - Colocar otro portaobjetos sobre la muestra y
   • Motivo de petición                                                           presionar los dos portaobjetos
   • Cualquier otra información aportada en el volante                         - Desplazar el portaobjetos superior sobre el
     de la petición                                                               que contiene la muestra hasta separarlos
De una manera general podemos considerar estos                                 - Repetir este último paso hasta conseguir una
tipos de procesamiento de las muestras para                                       extensión fina
microbiología de la siguiente forma:                                         7.2.2.3. Líquidos
7.2.1.- Pretratamiento de la muestra                                           - Depositar una gota de líquido sobre un
   7.2.1.1. Centrifugación                                                        portaobjetos y dejar secar
   - Centrifugar todos los líquidos en volumen                                 - Citocentrifugar unas gotas de líquido 5-10
     superior a 1ml a 2.500 rpm durante 15 minutos                                min. a velocidad media
   - Centrifugar sangre a 3.500 rpm durante 3-5
     minutos para detección de antígenos y/o                                7.2.2.4. Muestras en torunda
     anticuerpos                                                               - Colocar la torunda sobre un portaobjetos
   - Otras técnicas de concentración específicas:                              - Añadir sobre la torunda una pequeña
     precipitación en etanol, ultracentrifugación                                cantidad de caldo de cultivo
     selectiva, etc.                                                           - Realizar movimientos rotatorios, exprimiendo
   7.2.1.2. Homogeneización                                                      la torunda sobre el portaobjetos
     7.2.1.2.1 Mediante hoja de bisturí                                 7.2.3. Inoculación de la muestra en los medios de
     - Traspasar la muestra a una placa de Petri                        cultivo: selección de los medios: (ver tabla 7)
       estéril. Con ayuda de una hoja de bisturí                            7.2.3.1. Piezas no triturables
       desmenuzar el tejido hasta obtener una                               Si la pieza es pequeña, introducirla en un caldo
       consistencia homogénea.                                              de cultivo e incubar 24 horas tras lo cual se
     - Traspasar la muestra homogenizada a un                               harán subcultivos a los medios necesarios.
       contenedor estéril con ayuda de una pipeta                           - Si la muestra es grande, añadir al contenedor
       Pasteur.                                                                en el que se recibe 10-20 ml de caldo de
     7.2.1.2.2. Mediante mortero                                               enriquecimiento e incubar inmediatamente.
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