Centro de Investigación en Agrigenómica - 26 Noviembre 2019 - Biovegen

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Centro de Investigación en Agrigenómica - 26 Noviembre 2019 - Biovegen
Centro de Investigación
                       en Agrigenómica

26 Noviembre 2019                      Jornada CSIC-EMPRESAS: tecnología al servicio de la agricultura
Centro de Investigación en Agrigenómica - 26 Noviembre 2019 - Biovegen
• La IDEA FUNDACIONAL: Un entorno de investigación sólido y común, que abarca desde
  la ciencia básica hasta la investigación aplicada, para fomentar la investigación
  interdisciplinar, colaborativa y traslacional.

• El CRAG abarca una amplia gama de temas de biología vegetal e investigación genómica
  en sistemas modelo, cultivos y animales de granja.

                                                          Jornada CSIC-EMPRESAS: tecnología al servicio de la agricultura
Centro de Investigación en Agrigenómica - 26 Noviembre 2019 - Biovegen
“del gen y el genoma al fenotipo y el fenoma”
                         ‘genómica computacional / biología de sistemas / bioinformática / modelización'

    Bases genéticas, moleculares y mecanismos de                                Metabolismo secundario y vías de interés nutricional.
versabilidad y plasticidad de crecimiento y desarrollo de                       Regulación del metabolismo de las plantas.
                        las plantas

    Reconocimiento de organismos patógenos, transducción de                          Bases genéticas de caracteres agronómicamente importantes en
                señal y respuesta de las plantas.                                   cultivos y animales de granja y estructura y evolución de genomas
                                                                                                          de plantas y animales.

                                                                                                           Jornada CSIC-EMPRESAS: tecnología al servicio de la agricultura
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Jornada CSIC-EMPRESAS: tecnología al servicio de la agricultura
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-                                                  Riesgo                                                               +
Apoyo directo a la     Contrato de          Financiación       Unidades Mixtas             Spin-off
empresa                colaboración         público-privado    empresa-CRAG
Servicio de análisis   Anual, plurianual,   Doctorados         Actuaciones a nivel         Valorización de la
genéticos              por objetivos        Industriales       privado y                   investigación
                                                               colaboración en
                                                               proyectos públicos
Servicio genómica                           Torres Quevedo                                        SUMOblock
Servicio Agronomía
                                                    Vitrus                                   Plant Nanohealing

                         Front Range
                         Biosciences,Inc      Trichopharming
                         Fito
                         BioIbérica
                         JAER, Copsemar
                                                                        Jornada CSIC-EMPRESAS: tecnología al servicio de la agricultura
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Servicio de Análisis Genéticos

El servicio ofrece el desarrollo de marcadores (principalmente SNP y SSR)
y el genotipado para proyectos de investigación públicos, así como                               Contact:
programas de mejora privados para un amplio espectro de especies.

                                                                                                     Werner Howad
                                                                                                     Service Manager
                                                                                                     werner.howad@irta.cat

                                                                                        1. Cultivar Identification
                                                                                        - Germplasm characterization
                                                                                        - Genetic variability studies
                                                                                        - Pedigree and quality control

                                                                                        2. Hybrid Purity Testing
                                                                                        - Purity test of hybrid seed production
                                                                                        - New hybrid and pedigree control

                                                                                        3. Major Gene Detection
    Problem                                                                             - Genetic map construction
    sample                                                                              - QTL analysis
                                                                                        - Association genetics

                                                                                        4. Marker-Assisted Selection (MAS)
                                                                                        - In a wide range of species: resistance genes
                                                                                        - Prunus: acidity, round/flat fruit, peach/nectarine,
                                                                                        - Strawberry, seasonal flowering

                                                                                        5. Special Breeding Applications
                                                                                        - Whole genome selection (e.g. introduction of exotic alleles)

                      SSRs
                                                                  SNPs      Jornada CSIC-EMPRESAS: tecnología al servicio de la agricultura
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Phenotyping                               Molecular markers
                                                             development

     Analysis of genomes

                                                                       Genes and QTL
                                                                          mapping

 Development of new
 breeding materials

                                                                                Gene validation

                                      CRISPR/Cas9

           Marker assisted breeding
           strategies
Amparo.monfort@cragenomica.es              Jornada CSIC-EMPRESAS: tecnología al servicio de la agricultura
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Obtención de plantas resistentes a gran variedad
                                                                  de agentes patogénicos
  Producción de hormonas
vegetales en microorganismos                                         Micro                 Inmunidad
                                                                     ARNs
                                                  ARNs pequeños funcionalmente conservados en diversas especies, incluyendo de
                                               interés comercial como tomate y cereales, regulan la respuesta inmune de las plantas.

          Filosfera    Bacterias   Hormonas
                        Hongos     vegetales

           Rizosfera

                                                                                             Plectospharaella
                                                                                                  Producción de cucumerina
                                                                                                                biomasa y
                                                                                                                semillas
                                                             Resistencia a Hongos

  Ignacio.rubio@Cragenomica.es
                                                La modulación racional de la actividad de ARNs de pequeño tamaño facilita la obtención
                                                   de plantas resistentes a gran variedad de agentes patogénicos (Virus, bacterias ,
                                                                  oomicetos y hongos) sin afectar a su productividad.
                                                                                                  Boccara et al., 2014; MoRE Lab manuscript in
                                                                                                                    preparation

                                                                                          Jornada CSIC-EMPRESAS: tecnología al servicio de la agricultura
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                               Fungal AntiFungal Proteins                                                                   information, please
        AntiFungal Proteins (AFPs) secreted by filamentous fungi as novel antifungal compounds to                           contact
        face fungal pathogens for food security, food safety, and human and animal health                                   maria.coca@
                                                                                                                            cragenomica.es
AFP production system in plant biofactories
   Transient, fast, efficient AFP production system
                                                      Protection against Botrytis mold in tomato

                                                                                       Control

                                                                                       AgAFP

                                                                                       PdAfpB

                                                                                       PeAfpA

                                   AFP
                  C GFP 1         2   3     4         Protection against Blast Disease in rice

                                                                                                     Control

                                                                                                     PdAfpB

                                                                                                 Jornada CSIC-EMPRESAS: tecnología al servicio de la agricultura
Centro de Investigación en Agrigenómica - 26 Noviembre 2019 - Biovegen
SUMO group: Exploiting protein regulation by SUMO.
                                                                   “IDRICA – Improving Drought Resistance in
                                                                            Crops and Arabidopsis”
     Regulation of seed        Development of novel
 development and defense    molecules to modulate SUMO
    responses to fungus     conjugation as agrochemicals

                                                           Arabidopsis             Sorghum

                                                           Using Brassinosteroid signaling in the root to investigate the mechanism
                                                           for drought stress resistance in plants and to design novel molecules able to
                                                           confer resistance to the drought stress  To provide sustainable solutions to
                                                                   enhance crop production in limiting water environments.
                                iSUMO1      iSUMO2

                                                                                                               Ana I. Caño-Delgado

         Maria.lois@cragenomica.es

                                                                              Jornada CSIC-EMPRESAS: tecnología al servicio de la agricultura
PLANT NANOHEALING
    Grupo de fitopatógenos y muerte celular                         Grupo de Nanopartículas y Nanocompuestos
    Núria Sánchez Coll, CRAG                                        Dr. Anna Laromaine, ICMAB-CSIC

BC-AgNPs: Antipatogénico                                          BC: Cicatrizante y regenerador

    BC          BC-AgNPs

Alonso-Díaz et al.,
ACS Biomat Sci Eng, 2019      Ejemplo: infección fúngica                                           Nuevos cloroplastos

                                                   Aplicaciones agrícolas

   Injertos       Cultivo in vitro      Flores ornamentales            Poda                Post-cosecha           Corcho
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                                                 Jornada CSIC-EMPRESAS: tecnología al servicio de la agricultura
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